Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GCNT1Q02742 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCNT1Q02742 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCNT1Q02742 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCNT1Q02742 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCNT1Q02742 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCNT1Q02742 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GCNT1Q02742 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GCNT1Q02742 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GCNT1Q02742 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GCNT1Q02742 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GCNT1Q02742 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GCNT1Q02742 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GCNT1Q02742 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GCNT1Q02742 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GCNT1Q02742 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GCNT1Q02742 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GCNT1Q02742 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
GCNT1Q02742 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GCNT1Q02742 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GCNT1Q02742 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GCNT1Q02742 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GCNT1Q02742 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GCNT1Q02742 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GCNT1Q02742 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GCNT1Q02742 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GCNT1Q02742 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GCNT1Q02742 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GCNT1Q02742 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GCNT1Q02742 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GCNT1Q02742 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GCNT1Q02742 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GCNT1Q02742 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GCNT1Q02742 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GCNT1Q02742 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GCNT1Q02742 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GCNT1Q02742 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GCNT1Q02742 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GCNT1Q02742 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GCNT1Q02742 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GCNT1Q02742 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GCNT1Q02742 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GCNT1Q02742 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GCNT1Q02742 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GCNT1Q02742 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GCNT1Q02742 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GCNT1Q02742 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GCNT1Q02742 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GCNT1Q02742 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GCNT1Q02742 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GCNT1Q02742 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GCNT1Q02742 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GCNT1Q02742 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GCNT1Q02742 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GCNT1Q02742 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GCNT1Q02742 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GCNT1Q02742 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GCNT1Q02742 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GCNT1Q02742 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GCNT1Q02742 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GCNT1Q02742 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GCNT1Q02742 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GCNT1Q02742 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GCNT1Q02742 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GCNT1Q02742 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GCNT1Q02742 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GCNT1Q02742 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GCNT1Q02742 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GCNT1Q02742 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GCNT1Q02742 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GCNT1Q02742 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GCNT1Q02742 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GCNT1Q02742 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GCNT1Q02742 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GCNT1Q02742 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GCNT1Q02742 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GCNT1Q02742 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GCNT1Q02742 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GCNT1Q02742 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GCNT1Q02742 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GCNT1Q02742 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GCNT1Q02742 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GCNT1Q02742 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GCNT1Q02742 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GCNT1Q02742 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCNT1Q02742 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCNT1Q02742 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCNT1Q02742 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCNT1Q02742 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCNT1Q02742 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCNT1Q02742 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCNT1Q02742 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCNT1Q02742 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCNT1Q02742 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCNT1Q02742 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCNT1Q02742 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCNT1Q02742 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCNT1Q02742 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GCNT1Q02742 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GCNT1Q02742 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms