Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ID3Q02535 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ID3Q02535 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ID3Q02535 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ID3Q02535 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ID3Q02535 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ID3Q02535 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ID3Q02535 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ID3Q02535 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ID3Q02535 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ID3Q02535 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ID3Q02535 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ID3Q02535 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ID3Q02535 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ID3Q02535 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ID3Q02535 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ID3Q02535 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ID3Q02535 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ID3Q02535 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ID3Q02535 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ID3Q02535 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ID3Q02535 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ID3Q02535 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ID3Q02535 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ID3Q02535 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ID3Q02535 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ID3Q02535 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ID3Q02535 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ID3Q02535 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ID3Q02535 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ID3Q02535 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ID3Q02535 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ID3Q02535 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ID3Q02535 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ID3Q02535 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ID3Q02535 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ID3Q02535 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ID3Q02535 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ID3Q02535 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ID3Q02535 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ID3Q02535 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ID3Q02535 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ID3Q02535 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ID3Q02535 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ID3Q02535 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ID3Q02535 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ID3Q02535 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ID3Q02535 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ID3Q02535 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ID3Q02535 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ID3Q02535 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ID3Q02535 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ID3Q02535 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ID3Q02535 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ID3Q02535 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ID3Q02535 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ID3Q02535 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ID3Q02535 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ID3Q02535 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ID3Q02535 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ID3Q02535 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ID3Q02535 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ID3Q02535 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ID3Q02535 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ID3Q02535 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ID3Q02535 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ID3Q02535 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ID3Q02535 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ID3Q02535 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ID3Q02535 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ID3Q02535 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ID3Q02535 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ID3Q02535 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ID3Q02535 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ID3Q02535 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ID3Q02535 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ID3Q02535 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ID3Q02535 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ID3Q02535 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ID3Q02535 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ID3Q02535 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ID3Q02535 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ID3Q02535 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ID3Q02535 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ID3Q02535 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ID3Q02535 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ID3Q02535 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ID3Q02535 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ID3Q02535 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ID3Q02535 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ID3Q02535 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ID3Q02535 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ID3Q02535 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ID3Q02535 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ID3Q02535 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ID3Q02535 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ID3Q02535 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ID3Q02535 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ID3Q02535 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ID3Q02535 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms