Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFKB2Q00653 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFKB2Q00653 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFKB2Q00653 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFKB2Q00653 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NFKB2Q00653 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NFKB2Q00653 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFKB2Q00653 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFKB2Q00653 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFKB2Q00653 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFKB2Q00653 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFKB2Q00653 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFKB2Q00653 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFKB2Q00653 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFKB2Q00653 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFKB2Q00653 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFKB2Q00653 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFKB2Q00653 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFKB2Q00653 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFKB2Q00653 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFKB2Q00653 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFKB2Q00653 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFKB2Q00653 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFKB2Q00653 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NFKB2Q00653 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFKB2Q00653 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFKB2Q00653 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFKB2Q00653 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFKB2Q00653 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFKB2Q00653 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFKB2Q00653 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFKB2Q00653 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NFKB2Q00653 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NFKB2Q00653 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NFKB2Q00653 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFKB2Q00653 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFKB2Q00653 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFKB2Q00653 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFKB2Q00653 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFKB2Q00653 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NFKB2Q00653 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NFKB2Q00653 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFKB2Q00653 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFKB2Q00653 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFKB2Q00653 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFKB2Q00653 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFKB2Q00653 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFKB2Q00653 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NFKB2Q00653 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFKB2Q00653 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFKB2Q00653 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFKB2Q00653 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFKB2Q00653 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFKB2Q00653 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFKB2Q00653 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFKB2Q00653 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFKB2Q00653 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFKB2Q00653 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFKB2Q00653 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFKB2Q00653 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFKB2Q00653 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFKB2Q00653 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFKB2Q00653 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFKB2Q00653 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFKB2Q00653 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFKB2Q00653 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFKB2Q00653 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NFKB2Q00653 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFKB2Q00653 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NFKB2Q00653 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NFKB2Q00653 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NFKB2Q00653 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NFKB2Q00653 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFKB2Q00653 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFKB2Q00653 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFKB2Q00653 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFKB2Q00653 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFKB2Q00653 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFKB2Q00653 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFKB2Q00653 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFKB2Q00653 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFKB2Q00653 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFKB2Q00653 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFKB2Q00653 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFKB2Q00653 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFKB2Q00653 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFKB2Q00653 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFKB2Q00653 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFKB2Q00653 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NFKB2Q00653 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NFKB2Q00653 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NFKB2Q00653 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFKB2Q00653 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NFKB2Q00653 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFKB2Q00653 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFKB2Q00653 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFKB2Q00653 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFKB2Q00653 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFKB2Q00653 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFKB2Q00653 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.3 ms