Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF2BQ00403 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF2BQ00403 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF2BQ00403 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF2BQ00403 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF2BQ00403 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF2BQ00403 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF2BQ00403 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF2BQ00403 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF2BQ00403 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF2BQ00403 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF2BQ00403 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF2BQ00403 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF2BQ00403 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF2BQ00403 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF2BQ00403 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF2BQ00403 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF2BQ00403 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF2BQ00403 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF2BQ00403 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF2BQ00403 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF2BQ00403 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF2BQ00403 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF2BQ00403 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF2BQ00403 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF2BQ00403 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF2BQ00403 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF2BQ00403 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF2BQ00403 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
GTF2BQ00403 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2BQ00403 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2BQ00403 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2BQ00403 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2BQ00403 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2BQ00403 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF2BQ00403 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF2BQ00403 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF2BQ00403 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF2BQ00403 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF2BQ00403 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF2BQ00403 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF2BQ00403 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2BQ00403 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2BQ00403 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2BQ00403 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2BQ00403 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2BQ00403 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2BQ00403 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2BQ00403 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2BQ00403 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2BQ00403 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2BQ00403 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF2BQ00403 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF2BQ00403 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF2BQ00403 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF2BQ00403 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF2BQ00403 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
GTF2BQ00403 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2BQ00403 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2BQ00403 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2BQ00403 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2BQ00403 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2BQ00403 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2BQ00403 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2BQ00403 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2BQ00403 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2BQ00403 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2BQ00403 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2BQ00403 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2BQ00403 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2BQ00403 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2BQ00403 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2BQ00403 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2BQ00403 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2BQ00403 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2BQ00403 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2BQ00403 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2BQ00403 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2BQ00403 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2BQ00403 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2BQ00403 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF2BQ00403 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF2BQ00403 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF2BQ00403 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF2BQ00403 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF2BQ00403 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF2BQ00403 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF2BQ00403 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF2BQ00403 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF2BQ00403 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF2BQ00403 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF2BQ00403 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF2BQ00403 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF2BQ00403 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF2BQ00403 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF2BQ00403 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF2BQ00403 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF2BQ00403 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF2BQ00403 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF2BQ00403 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms