Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 4,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKD1P98161 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PKD1P98161 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKD1P98161 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PKD1P98161 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKD1P98161 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PKD1P98161 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PKD1P98161 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKD1P98161 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKD1P98161 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKD1P98161 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKD1P98161 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKD1P98161 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKD1P98161 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKD1P98161 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKD1P98161 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKD1P98161 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKD1P98161 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKD1P98161 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PKD1P98161 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKD1P98161 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKD1P98161 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKD1P98161 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKD1P98161 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKD1P98161 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKD1P98161 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PKD1P98161 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKD1P98161 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKD1P98161 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PKD1P98161 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKD1P98161 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKD1P98161 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKD1P98161 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PKD1P98161 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKD1P98161 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PKD1P98161 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKD1P98161 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKD1P98161 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKD1P98161 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKD1P98161 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKD1P98161 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKD1P98161 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKD1P98161 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKD1P98161 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKD1P98161 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PKD1P98161 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKD1P98161 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PKD1P98161 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKD1P98161 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKD1P98161 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PKD1P98161 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKD1P98161 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKD1P98161 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKD1P98161 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKD1P98161 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKD1P98161 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PKD1P98161 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PKD1P98161 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKD1P98161 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKD1P98161 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PKD1P98161 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKD1P98161 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKD1P98161 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PKD1P98161 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKD1P98161 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKD1P98161 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKD1P98161 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKD1P98161 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKD1P98161 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKD1P98161 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKD1P98161 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKD1P98161 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKD1P98161 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKD1P98161 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKD1P98161 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKD1P98161 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKD1P98161 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKD1P98161 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKD1P98161 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKD1P98161 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKD1P98161 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKD1P98161 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKD1P98161 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKD1P98161 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKD1P98161 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKD1P98161 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKD1P98161 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKD1P98161 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKD1P98161 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKD1P98161 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKD1P98161 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKD1P98161 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKD1P98161 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKD1P98161 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKD1P98161 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKD1P98161 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PKD1P98161 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PKD1P98161 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PKD1P98161 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PKD1P98161 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms