Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPCAP84074 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPCAP84074 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPCAP84074 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPCAP84074 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPCAP84074 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPCAP84074 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPCAP84074 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPCAP84074 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPCAP84074 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPCAP84074 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPCAP84074 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPCAP84074 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPCAP84074 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPCAP84074 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPCAP84074 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPCAP84074 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HPCAP84074 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPCAP84074 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPCAP84074 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HPCAP84074 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPCAP84074 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPCAP84074 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HPCAP84074 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPCAP84074 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPCAP84074 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPCAP84074 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPCAP84074 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPCAP84074 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPCAP84074 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPCAP84074 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HPCAP84074 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HPCAP84074 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPCAP84074 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPCAP84074 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPCAP84074 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPCAP84074 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPCAP84074 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPCAP84074 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPCAP84074 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPCAP84074 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPCAP84074 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPCAP84074 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPCAP84074 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPCAP84074 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPCAP84074 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPCAP84074 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPCAP84074 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPCAP84074 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPCAP84074 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPCAP84074 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPCAP84074 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPCAP84074 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPCAP84074 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPCAP84074 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPCAP84074 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPCAP84074 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPCAP84074 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPCAP84074 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPCAP84074 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPCAP84074 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HPCAP84074 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPCAP84074 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPCAP84074 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPCAP84074 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPCAP84074 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPCAP84074 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPCAP84074 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPCAP84074 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPCAP84074 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPCAP84074 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPCAP84074 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPCAP84074 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPCAP84074 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPCAP84074 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPCAP84074 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPCAP84074 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPCAP84074 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPCAP84074 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HPCAP84074 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HPCAP84074 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPCAP84074 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPCAP84074 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPCAP84074 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPCAP84074 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPCAP84074 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPCAP84074 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPCAP84074 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPCAP84074 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPCAP84074 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HPCAP84074 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HPCAP84074 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPCAP84074 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPCAP84074 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPCAP84074 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPCAP84074 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPCAP84074 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPCAP84074 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPCAP84074 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPCAP84074 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.5 ms