Protein–RNA interactions for Protein: P78413

IRX4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX4P78413 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX4P78413 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX4P78413 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX4P78413 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX4P78413 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX4P78413 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRX4P78413 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRX4P78413 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRX4P78413 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX4P78413 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX4P78413 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX4P78413 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX4P78413 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX4P78413 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX4P78413 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX4P78413 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX4P78413 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX4P78413 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX4P78413 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX4P78413 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX4P78413 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX4P78413 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRX4P78413 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
IRX4P78413 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRX4P78413 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRX4P78413 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRX4P78413 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRX4P78413 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IRX4P78413 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IRX4P78413 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRX4P78413 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRX4P78413 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
IRX4P78413 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRX4P78413 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRX4P78413 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
IRX4P78413 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRX4P78413 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRX4P78413 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRX4P78413 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRX4P78413 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX4P78413 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX4P78413 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX4P78413 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX4P78413 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX4P78413 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX4P78413 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX4P78413 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRX4P78413 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
IRX4P78413 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX4P78413 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX4P78413 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX4P78413 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX4P78413 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX4P78413 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX4P78413 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRX4P78413 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRX4P78413 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRX4P78413 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
IRX4P78413 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRX4P78413 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRX4P78413 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRX4P78413 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRX4P78413 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRX4P78413 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRX4P78413 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRX4P78413 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRX4P78413 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
IRX4P78413 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRX4P78413 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRX4P78413 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRX4P78413 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRX4P78413 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRX4P78413 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX4P78413 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX4P78413 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX4P78413 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX4P78413 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX4P78413 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX4P78413 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX4P78413 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX4P78413 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX4P78413 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX4P78413 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX4P78413 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX4P78413 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX4P78413 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX4P78413 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX4P78413 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX4P78413 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX4P78413 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX4P78413 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX4P78413 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX4P78413 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX4P78413 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX4P78413 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRX4P78413 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRX4P78413 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRX4P78413 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRX4P78413 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRX4P78413 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms