Protein–RNA interactions for Protein: P63173

RPL38, 60S ribosomal protein L38, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL38P63173 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL38P63173 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL38P63173 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL38P63173 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL38P63173 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL38P63173 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL38P63173 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL38P63173 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL38P63173 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL38P63173 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL38P63173 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL38P63173 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL38P63173 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL38P63173 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL38P63173 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL38P63173 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL38P63173 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL38P63173 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL38P63173 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL38P63173 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL38P63173 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL38P63173 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL38P63173 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL38P63173 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL38P63173 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL38P63173 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPL38P63173 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPL38P63173 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPL38P63173 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPL38P63173 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPL38P63173 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPL38P63173 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RPL38P63173 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPL38P63173 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPL38P63173 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPL38P63173 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPL38P63173 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPL38P63173 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPL38P63173 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPL38P63173 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPL38P63173 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPL38P63173 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RPL38P63173 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPL38P63173 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPL38P63173 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPL38P63173 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL38P63173 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL38P63173 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL38P63173 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL38P63173 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL38P63173 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL38P63173 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL38P63173 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL38P63173 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL38P63173 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL38P63173 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL38P63173 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL38P63173 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL38P63173 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL38P63173 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL38P63173 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPL38P63173 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPL38P63173 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPL38P63173 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPL38P63173 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPL38P63173 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL38P63173 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL38P63173 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL38P63173 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL38P63173 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL38P63173 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL38P63173 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPL38P63173 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPL38P63173 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RPL38P63173 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPL38P63173 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL38P63173 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL38P63173 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL38P63173 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL38P63173 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL38P63173 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL38P63173 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL38P63173 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL38P63173 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL38P63173 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL38P63173 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL38P63173 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL38P63173 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL38P63173 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL38P63173 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL38P63173 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPL38P63173 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPL38P63173 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPL38P63173 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPL38P63173 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPL38P63173 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPL38P63173 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPL38P63173 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPL38P63173 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPL38P63173 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms