Protein–RNA interactions for Protein: P62424

RPL7A, 60S ribosomal protein L7a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL7AP62424 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPL7AP62424 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPL7AP62424 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPL7AP62424 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPL7AP62424 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPL7AP62424 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPL7AP62424 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPL7AP62424 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPL7AP62424 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPL7AP62424 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPL7AP62424 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPL7AP62424 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPL7AP62424 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPL7AP62424 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RPL7AP62424 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RPL7AP62424 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
RPL7AP62424 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RPL7AP62424 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPL7AP62424 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPL7AP62424 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RPL7AP62424 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPL7AP62424 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RPL7AP62424 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPL7AP62424 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPL7AP62424 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPL7AP62424 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPL7AP62424 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPL7AP62424 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPL7AP62424 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPL7AP62424 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPL7AP62424 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RPL7AP62424 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPL7AP62424 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPL7AP62424 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPL7AP62424 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPL7AP62424 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RPL7AP62424 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPL7AP62424 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPL7AP62424 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPL7AP62424 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPL7AP62424 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPL7AP62424 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPL7AP62424 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPL7AP62424 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPL7AP62424 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPL7AP62424 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPL7AP62424 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPL7AP62424 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPL7AP62424 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPL7AP62424 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPL7AP62424 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPL7AP62424 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPL7AP62424 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPL7AP62424 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPL7AP62424 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPL7AP62424 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPL7AP62424 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPL7AP62424 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RPL7AP62424 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPL7AP62424 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPL7AP62424 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPL7AP62424 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPL7AP62424 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPL7AP62424 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPL7AP62424 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPL7AP62424 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPL7AP62424 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPL7AP62424 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPL7AP62424 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPL7AP62424 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL7AP62424 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL7AP62424 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL7AP62424 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL7AP62424 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL7AP62424 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL7AP62424 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL7AP62424 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL7AP62424 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPL7AP62424 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPL7AP62424 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPL7AP62424 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPL7AP62424 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPL7AP62424 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPL7AP62424 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RPL7AP62424 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPL7AP62424 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RPL7AP62424 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPL7AP62424 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPL7AP62424 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPL7AP62424 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL7AP62424 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL7AP62424 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL7AP62424 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL7AP62424 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL7AP62424 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL7AP62424 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL7AP62424 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL7AP62424 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL7AP62424 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL7AP62424 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms