Protein–RNA interactions for Protein: P58511

SMIM11A, Small integral membrane protein 11A, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM11AP58511 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM11AP58511 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM11AP58511 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM11AP58511 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM11AP58511 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM11AP58511 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM11AP58511 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM11AP58511 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM11AP58511 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM11AP58511 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM11AP58511 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM11AP58511 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM11AP58511 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM11AP58511 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM11AP58511 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM11AP58511 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM11AP58511 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM11AP58511 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM11AP58511 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM11AP58511 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM11AP58511 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM11AP58511 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM11AP58511 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM11AP58511 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM11AP58511 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM11AP58511 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM11AP58511 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM11AP58511 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM11AP58511 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM11AP58511 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM11AP58511 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM11AP58511 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMIM11AP58511 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMIM11AP58511 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM11AP58511 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMIM11AP58511 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMIM11AP58511 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMIM11AP58511 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMIM11AP58511 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMIM11AP58511 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM11AP58511 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms