Protein–RNA interactions for Protein: P56962

STX17, Syntaxin-17, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX17P56962 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STX17P56962 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
STX17P56962 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
STX17P56962 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STX17P56962 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
STX17P56962 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
STX17P56962 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STX17P56962 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STX17P56962 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STX17P56962 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
STX17P56962 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
STX17P56962 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STX17P56962 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STX17P56962 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STX17P56962 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STX17P56962 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STX17P56962 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STX17P56962 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STX17P56962 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
STX17P56962 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
STX17P56962 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
STX17P56962 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
STX17P56962 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STX17P56962 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
STX17P56962 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STX17P56962 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STX17P56962 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STX17P56962 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STX17P56962 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
STX17P56962 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
STX17P56962 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STX17P56962 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
STX17P56962 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
STX17P56962 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
STX17P56962 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
STX17P56962 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
STX17P56962 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
STX17P56962 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
STX17P56962 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
STX17P56962 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
STX17P56962 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
STX17P56962 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STX17P56962 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STX17P56962 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STX17P56962 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
STX17P56962 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
STX17P56962 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
STX17P56962 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
STX17P56962 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
STX17P56962 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
STX17P56962 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
STX17P56962 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
STX17P56962 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
STX17P56962 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
STX17P56962 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
STX17P56962 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STX17P56962 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
STX17P56962 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STX17P56962 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STX17P56962 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STX17P56962 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STX17P56962 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STX17P56962 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STX17P56962 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
STX17P56962 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
STX17P56962 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
STX17P56962 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
STX17P56962 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
STX17P56962 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
STX17P56962 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
STX17P56962 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
STX17P56962 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
STX17P56962 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
STX17P56962 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
STX17P56962 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
STX17P56962 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
STX17P56962 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
STX17P56962 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
STX17P56962 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
STX17P56962 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
STX17P56962 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
STX17P56962 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
STX17P56962 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
STX17P56962 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
STX17P56962 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
STX17P56962 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
STX17P56962 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
STX17P56962 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
STX17P56962 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
STX17P56962 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
STX17P56962 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
STX17P56962 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
STX17P56962 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
STX17P56962 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
STX17P56962 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
STX17P56962 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
STX17P56962 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
STX17P56962 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
STX17P56962 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
STX17P56962 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms