Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NME5P56597 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NME5P56597 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NME5P56597 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NME5P56597 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NME5P56597 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NME5P56597 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NME5P56597 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NME5P56597 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NME5P56597 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NME5P56597 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NME5P56597 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NME5P56597 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NME5P56597 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NME5P56597 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NME5P56597 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NME5P56597 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME5P56597 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME5P56597 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME5P56597 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME5P56597 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME5P56597 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME5P56597 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME5P56597 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME5P56597 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME5P56597 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME5P56597 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME5P56597 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME5P56597 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME5P56597 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME5P56597 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME5P56597 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME5P56597 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME5P56597 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME5P56597 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NME5P56597 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NME5P56597 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NME5P56597 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NME5P56597 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NME5P56597 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NME5P56597 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NME5P56597 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NME5P56597 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NME5P56597 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NME5P56597 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NME5P56597 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NME5P56597 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NME5P56597 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NME5P56597 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NME5P56597 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NME5P56597 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NME5P56597 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NME5P56597 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NME5P56597 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NME5P56597 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NME5P56597 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NME5P56597 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NME5P56597 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NME5P56597 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NME5P56597 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NME5P56597 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NME5P56597 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NME5P56597 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NME5P56597 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NME5P56597 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NME5P56597 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NME5P56597 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NME5P56597 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NME5P56597 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NME5P56597 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NME5P56597 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NME5P56597 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NME5P56597 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NME5P56597 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME5P56597 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME5P56597 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME5P56597 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME5P56597 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME5P56597 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME5P56597 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME5P56597 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NME5P56597 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME5P56597 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME5P56597 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME5P56597 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NME5P56597 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NME5P56597 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NME5P56597 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NME5P56597 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NME5P56597 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NME5P56597 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NME5P56597 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NME5P56597 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME5P56597 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME5P56597 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME5P56597 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME5P56597 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME5P56597 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME5P56597 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME5P56597 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms