Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH15P55291 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH15P55291 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH15P55291 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH15P55291 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH15P55291 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH15P55291 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH15P55291 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH15P55291 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH15P55291 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH15P55291 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH15P55291 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH15P55291 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH15P55291 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH15P55291 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH15P55291 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH15P55291 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH15P55291 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH15P55291 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH15P55291 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH15P55291 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH15P55291 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH15P55291 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH15P55291 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH15P55291 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH15P55291 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH15P55291 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH15P55291 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH15P55291 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH15P55291 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH15P55291 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH15P55291 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH15P55291 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH15P55291 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH15P55291 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH15P55291 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH15P55291 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH15P55291 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH15P55291 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH15P55291 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH15P55291 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH15P55291 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH15P55291 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH15P55291 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH15P55291 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH15P55291 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH15P55291 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH15P55291 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH15P55291 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH15P55291 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH15P55291 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH15P55291 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH15P55291 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH15P55291 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH15P55291 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH15P55291 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH15P55291 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH15P55291 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH15P55291 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH15P55291 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH15P55291 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH15P55291 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH15P55291 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH15P55291 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH15P55291 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH15P55291 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH15P55291 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH15P55291 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH15P55291 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH15P55291 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH15P55291 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH15P55291 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH15P55291 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH15P55291 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH15P55291 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH15P55291 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH15P55291 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH15P55291 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH15P55291 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH15P55291 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH15P55291 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH15P55291 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH15P55291 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH15P55291 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH15P55291 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH15P55291 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH15P55291 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH15P55291 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH15P55291 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH15P55291 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH15P55291 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH15P55291 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH15P55291 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CDH15P55291 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CDH15P55291 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH15P55291 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH15P55291 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH15P55291 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH15P55291 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH15P55291 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms