Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NAP1L1P55209 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NAP1L1P55209 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NAP1L1P55209 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NAP1L1P55209 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NAP1L1P55209 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NAP1L1P55209 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NAP1L1P55209 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NAP1L1P55209 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NAP1L1P55209 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NAP1L1P55209 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NAP1L1P55209 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
NAP1L1P55209 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NAP1L1P55209 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NAP1L1P55209 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NAP1L1P55209 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NAP1L1P55209 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NAP1L1P55209 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NAP1L1P55209 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NAP1L1P55209 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NAP1L1P55209 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NAP1L1P55209 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NAP1L1P55209 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NAP1L1P55209 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NAP1L1P55209 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NAP1L1P55209 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NAP1L1P55209 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NAP1L1P55209 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NAP1L1P55209 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NAP1L1P55209 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NAP1L1P55209 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NAP1L1P55209 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NAP1L1P55209 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NAP1L1P55209 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NAP1L1P55209 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NAP1L1P55209 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NAP1L1P55209 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NAP1L1P55209 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NAP1L1P55209 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NAP1L1P55209 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NAP1L1P55209 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NAP1L1P55209 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NAP1L1P55209 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NAP1L1P55209 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NAP1L1P55209 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NAP1L1P55209 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NAP1L1P55209 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NAP1L1P55209 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NAP1L1P55209 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NAP1L1P55209 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NAP1L1P55209 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NAP1L1P55209 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NAP1L1P55209 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NAP1L1P55209 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NAP1L1P55209 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NAP1L1P55209 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NAP1L1P55209 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NAP1L1P55209 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NAP1L1P55209 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NAP1L1P55209 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NAP1L1P55209 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NAP1L1P55209 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NAP1L1P55209 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NAP1L1P55209 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NAP1L1P55209 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NAP1L1P55209 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NAP1L1P55209 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NAP1L1P55209 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NAP1L1P55209 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NAP1L1P55209 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NAP1L1P55209 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NAP1L1P55209 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NAP1L1P55209 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NAP1L1P55209 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NAP1L1P55209 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NAP1L1P55209 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NAP1L1P55209 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NAP1L1P55209 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NAP1L1P55209 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NAP1L1P55209 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NAP1L1P55209 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NAP1L1P55209 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NAP1L1P55209 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NAP1L1P55209 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NAP1L1P55209 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NAP1L1P55209 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NAP1L1P55209 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NAP1L1P55209 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NAP1L1P55209 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NAP1L1P55209 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NAP1L1P55209 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NAP1L1P55209 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NAP1L1P55209 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NAP1L1P55209 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NAP1L1P55209 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NAP1L1P55209 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NAP1L1P55209 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NAP1L1P55209 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NAP1L1P55209 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NAP1L1P55209 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms