Protein–RNA interactions for Protein: P54136

RARS, Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARSP54136 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
RARSP54136 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
RARSP54136 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
RARSP54136 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
RARSP54136 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
RARSP54136 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RARSP54136 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
RARSP54136 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
RARSP54136 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RARSP54136 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
RARSP54136 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RARSP54136 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RARSP54136 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RARSP54136 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
RARSP54136 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RARSP54136 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
RARSP54136 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
RARSP54136 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RARSP54136 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RARSP54136 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RARSP54136 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RARSP54136 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
RARSP54136 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RARSP54136 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
RARSP54136 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RARSP54136 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RARSP54136 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
RARSP54136 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RARSP54136 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
RARSP54136 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
RARSP54136 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
RARSP54136 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
RARSP54136 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
RARSP54136 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
RARSP54136 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
RARSP54136 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
RARSP54136 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
RARSP54136 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
RARSP54136 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
RARSP54136 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
RARSP54136 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
RARSP54136 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
RARSP54136 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
RARSP54136 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
RARSP54136 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
RARSP54136 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
RARSP54136 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RARSP54136 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RARSP54136 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
RARSP54136 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
RARSP54136 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
RARSP54136 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
RARSP54136 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RARSP54136 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
RARSP54136 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
RARSP54136 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
RARSP54136 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
RARSP54136 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
RARSP54136 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
RARSP54136 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
RARSP54136 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
RARSP54136 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
RARSP54136 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
RARSP54136 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
RARSP54136 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RARSP54136 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
RARSP54136 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
RARSP54136 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RARSP54136 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RARSP54136 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
RARSP54136 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RARSP54136 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RARSP54136 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RARSP54136 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RARSP54136 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RARSP54136 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
RARSP54136 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
RARSP54136 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RARSP54136 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
RARSP54136 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
RARSP54136 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
RARSP54136 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RARSP54136 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
RARSP54136 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RARSP54136 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RARSP54136 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
RARSP54136 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
RARSP54136 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RARSP54136 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RARSP54136 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
RARSP54136 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RARSP54136 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RARSP54136 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RARSP54136 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RARSP54136 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RARSP54136 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RARSP54136 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RARSP54136 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RARSP54136 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RARSP54136 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms