Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LIMK2P53671 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LIMK2P53671 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LIMK2P53671 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LIMK2P53671 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LIMK2P53671 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LIMK2P53671 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LIMK2P53671 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LIMK2P53671 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LIMK2P53671 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIMK2P53671 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIMK2P53671 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIMK2P53671 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIMK2P53671 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIMK2P53671 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIMK2P53671 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIMK2P53671 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIMK2P53671 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIMK2P53671 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIMK2P53671 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIMK2P53671 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIMK2P53671 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIMK2P53671 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIMK2P53671 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIMK2P53671 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIMK2P53671 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIMK2P53671 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIMK2P53671 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIMK2P53671 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LIMK2P53671 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LIMK2P53671 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LIMK2P53671 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LIMK2P53671 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LIMK2P53671 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LIMK2P53671 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LIMK2P53671 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LIMK2P53671 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LIMK2P53671 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LIMK2P53671 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LIMK2P53671 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LIMK2P53671 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LIMK2P53671 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIMK2P53671 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIMK2P53671 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIMK2P53671 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIMK2P53671 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIMK2P53671 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIMK2P53671 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIMK2P53671 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LIMK2P53671 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIMK2P53671 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIMK2P53671 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LIMK2P53671 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIMK2P53671 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LIMK2P53671 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LIMK2P53671 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LIMK2P53671 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LIMK2P53671 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LIMK2P53671 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIMK2P53671 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIMK2P53671 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIMK2P53671 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIMK2P53671 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIMK2P53671 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIMK2P53671 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIMK2P53671 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIMK2P53671 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIMK2P53671 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIMK2P53671 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIMK2P53671 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIMK2P53671 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIMK2P53671 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LIMK2P53671 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIMK2P53671 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LIMK2P53671 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIMK2P53671 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LIMK2P53671 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIMK2P53671 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIMK2P53671 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIMK2P53671 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIMK2P53671 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIMK2P53671 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIMK2P53671 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIMK2P53671 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIMK2P53671 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIMK2P53671 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIMK2P53671 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIMK2P53671 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LIMK2P53671 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LIMK2P53671 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LIMK2P53671 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LIMK2P53671 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LIMK2P53671 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIMK2P53671 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIMK2P53671 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIMK2P53671 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LIMK2P53671 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LIMK2P53671 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LIMK2P53671 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LIMK2P53671 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms