Protein–RNA interactions for Protein: P52926

HMGA2, High mobility group protein HMGI-C, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGA2P52926 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGA2P52926 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGA2P52926 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGA2P52926 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGA2P52926 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGA2P52926 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGA2P52926 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGA2P52926 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGA2P52926 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGA2P52926 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGA2P52926 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGA2P52926 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGA2P52926 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGA2P52926 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGA2P52926 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGA2P52926 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGA2P52926 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGA2P52926 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGA2P52926 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGA2P52926 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGA2P52926 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGA2P52926 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGA2P52926 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGA2P52926 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGA2P52926 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGA2P52926 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGA2P52926 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGA2P52926 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGA2P52926 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGA2P52926 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGA2P52926 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGA2P52926 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGA2P52926 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGA2P52926 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGA2P52926 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGA2P52926 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGA2P52926 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HMGA2P52926 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HMGA2P52926 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HMGA2P52926 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
HMGA2P52926 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGA2P52926 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGA2P52926 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGA2P52926 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGA2P52926 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGA2P52926 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGA2P52926 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGA2P52926 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGA2P52926 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGA2P52926 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGA2P52926 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGA2P52926 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGA2P52926 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGA2P52926 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGA2P52926 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGA2P52926 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGA2P52926 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGA2P52926 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGA2P52926 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGA2P52926 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGA2P52926 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGA2P52926 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGA2P52926 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGA2P52926 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGA2P52926 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGA2P52926 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGA2P52926 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGA2P52926 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGA2P52926 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGA2P52926 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGA2P52926 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGA2P52926 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGA2P52926 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGA2P52926 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGA2P52926 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGA2P52926 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGA2P52926 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGA2P52926 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGA2P52926 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGA2P52926 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGA2P52926 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGA2P52926 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGA2P52926 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGA2P52926 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGA2P52926 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGA2P52926 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGA2P52926 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGA2P52926 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGA2P52926 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGA2P52926 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HMGA2P52926 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HMGA2P52926 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGA2P52926 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGA2P52926 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGA2P52926 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGA2P52926 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGA2P52926 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGA2P52926 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMGA2P52926 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HMGA2P52926 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms