Protein–RNA interactions for Protein: P52747

ZNF143, Zinc finger protein 143, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF143P52747 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF143P52747 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF143P52747 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF143P52747 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF143P52747 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF143P52747 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF143P52747 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF143P52747 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF143P52747 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF143P52747 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF143P52747 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF143P52747 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF143P52747 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF143P52747 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF143P52747 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF143P52747 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF143P52747 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF143P52747 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF143P52747 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF143P52747 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF143P52747 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF143P52747 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF143P52747 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF143P52747 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF143P52747 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF143P52747 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF143P52747 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF143P52747 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF143P52747 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF143P52747 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF143P52747 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF143P52747 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF143P52747 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF143P52747 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF143P52747 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF143P52747 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF143P52747 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF143P52747 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF143P52747 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF143P52747 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF143P52747 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF143P52747 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF143P52747 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF143P52747 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF143P52747 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF143P52747 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF143P52747 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF143P52747 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF143P52747 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF143P52747 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF143P52747 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF143P52747 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF143P52747 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF143P52747 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF143P52747 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF143P52747 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF143P52747 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF143P52747 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF143P52747 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF143P52747 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF143P52747 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF143P52747 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF143P52747 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF143P52747 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF143P52747 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF143P52747 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF143P52747 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF143P52747 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF143P52747 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF143P52747 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF143P52747 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF143P52747 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF143P52747 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF143P52747 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF143P52747 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF143P52747 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF143P52747 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF143P52747 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF143P52747 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF143P52747 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF143P52747 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZNF143P52747 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF143P52747 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF143P52747 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF143P52747 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF143P52747 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF143P52747 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF143P52747 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF143P52747 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF143P52747 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF143P52747 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF143P52747 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF143P52747 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF143P52747 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF143P52747 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF143P52747 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF143P52747 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF143P52747 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF143P52747 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF143P52747 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms