Protein–RNA interactions for Protein: P52435

POLR2J, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2JP52435 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2JP52435 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2JP52435 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2JP52435 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2JP52435 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2JP52435 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2JP52435 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2JP52435 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2JP52435 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2JP52435 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2JP52435 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2JP52435 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2JP52435 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2JP52435 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2JP52435 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2JP52435 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2JP52435 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2JP52435 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2JP52435 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2JP52435 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2JP52435 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2JP52435 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2JP52435 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2JP52435 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2JP52435 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2JP52435 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2JP52435 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2JP52435 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2JP52435 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2JP52435 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2JP52435 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2JP52435 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2JP52435 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2JP52435 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2JP52435 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2JP52435 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR2JP52435 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2JP52435 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2JP52435 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2JP52435 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2JP52435 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2JP52435 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2JP52435 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2JP52435 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms