Protein–RNA interactions for Protein: P51809

VAMP7, Vesicle-associated membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP7P51809 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VAMP7P51809 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VAMP7P51809 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VAMP7P51809 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VAMP7P51809 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
VAMP7P51809 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
VAMP7P51809 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VAMP7P51809 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
VAMP7P51809 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VAMP7P51809 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VAMP7P51809 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VAMP7P51809 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VAMP7P51809 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VAMP7P51809 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VAMP7P51809 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VAMP7P51809 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VAMP7P51809 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VAMP7P51809 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VAMP7P51809 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VAMP7P51809 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
VAMP7P51809 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VAMP7P51809 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VAMP7P51809 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VAMP7P51809 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
VAMP7P51809 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VAMP7P51809 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VAMP7P51809 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VAMP7P51809 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VAMP7P51809 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VAMP7P51809 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VAMP7P51809 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VAMP7P51809 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VAMP7P51809 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
VAMP7P51809 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VAMP7P51809 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VAMP7P51809 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VAMP7P51809 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VAMP7P51809 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VAMP7P51809 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VAMP7P51809 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VAMP7P51809 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VAMP7P51809 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VAMP7P51809 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VAMP7P51809 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VAMP7P51809 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VAMP7P51809 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VAMP7P51809 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VAMP7P51809 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VAMP7P51809 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VAMP7P51809 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VAMP7P51809 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VAMP7P51809 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VAMP7P51809 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VAMP7P51809 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VAMP7P51809 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VAMP7P51809 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VAMP7P51809 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VAMP7P51809 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VAMP7P51809 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VAMP7P51809 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VAMP7P51809 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VAMP7P51809 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VAMP7P51809 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VAMP7P51809 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VAMP7P51809 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VAMP7P51809 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VAMP7P51809 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VAMP7P51809 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VAMP7P51809 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
VAMP7P51809 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VAMP7P51809 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VAMP7P51809 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VAMP7P51809 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
VAMP7P51809 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VAMP7P51809 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
VAMP7P51809 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VAMP7P51809 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VAMP7P51809 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
VAMP7P51809 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
VAMP7P51809 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
VAMP7P51809 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
VAMP7P51809 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VAMP7P51809 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VAMP7P51809 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VAMP7P51809 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VAMP7P51809 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VAMP7P51809 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VAMP7P51809 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VAMP7P51809 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VAMP7P51809 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VAMP7P51809 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VAMP7P51809 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VAMP7P51809 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VAMP7P51809 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VAMP7P51809 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VAMP7P51809 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VAMP7P51809 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VAMP7P51809 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VAMP7P51809 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
VAMP7P51809 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms