Protein–RNA interactions for Protein: P51693

APLP1, Amyloid-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLP1P51693 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
APLP1P51693 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
APLP1P51693 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
APLP1P51693 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
APLP1P51693 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
APLP1P51693 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
APLP1P51693 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
APLP1P51693 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
APLP1P51693 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
APLP1P51693 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
APLP1P51693 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
APLP1P51693 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
APLP1P51693 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
APLP1P51693 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
APLP1P51693 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
APLP1P51693 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
APLP1P51693 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
APLP1P51693 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
APLP1P51693 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
APLP1P51693 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
APLP1P51693 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
APLP1P51693 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
APLP1P51693 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
APLP1P51693 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
APLP1P51693 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
APLP1P51693 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
APLP1P51693 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
APLP1P51693 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
APLP1P51693 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
APLP1P51693 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
APLP1P51693 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
APLP1P51693 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
APLP1P51693 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
APLP1P51693 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
APLP1P51693 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
APLP1P51693 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
APLP1P51693 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
APLP1P51693 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
APLP1P51693 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
APLP1P51693 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
APLP1P51693 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
APLP1P51693 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
APLP1P51693 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
APLP1P51693 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
APLP1P51693 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
APLP1P51693 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
APLP1P51693 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
APLP1P51693 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
APLP1P51693 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
APLP1P51693 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
APLP1P51693 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
APLP1P51693 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
APLP1P51693 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
APLP1P51693 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
APLP1P51693 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
APLP1P51693 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
APLP1P51693 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
APLP1P51693 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
APLP1P51693 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
APLP1P51693 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
APLP1P51693 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
APLP1P51693 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
APLP1P51693 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
APLP1P51693 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
APLP1P51693 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
APLP1P51693 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
APLP1P51693 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
APLP1P51693 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
APLP1P51693 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
APLP1P51693 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
APLP1P51693 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
APLP1P51693 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
APLP1P51693 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
APLP1P51693 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
APLP1P51693 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
APLP1P51693 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
APLP1P51693 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
APLP1P51693 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
APLP1P51693 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
APLP1P51693 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
APLP1P51693 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
APLP1P51693 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
APLP1P51693 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
APLP1P51693 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
APLP1P51693 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
APLP1P51693 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
APLP1P51693 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
APLP1P51693 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
APLP1P51693 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
APLP1P51693 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
APLP1P51693 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
APLP1P51693 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
APLP1P51693 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
APLP1P51693 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
APLP1P51693 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
APLP1P51693 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
APLP1P51693 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
APLP1P51693 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
APLP1P51693 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
APLP1P51693 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms