Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR4P51679 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR4P51679 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR4P51679 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR4P51679 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR4P51679 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR4P51679 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR4P51679 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR4P51679 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR4P51679 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR4P51679 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR4P51679 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR4P51679 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR4P51679 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR4P51679 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR4P51679 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR4P51679 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR4P51679 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR4P51679 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCR4P51679 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR4P51679 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR4P51679 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR4P51679 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR4P51679 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR4P51679 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR4P51679 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR4P51679 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR4P51679 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR4P51679 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR4P51679 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR4P51679 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR4P51679 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR4P51679 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR4P51679 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR4P51679 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR4P51679 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR4P51679 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR4P51679 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR4P51679 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR4P51679 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR4P51679 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR4P51679 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR4P51679 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR4P51679 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR4P51679 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR4P51679 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR4P51679 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR4P51679 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR4P51679 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR4P51679 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR4P51679 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR4P51679 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR4P51679 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR4P51679 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR4P51679 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR4P51679 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR4P51679 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR4P51679 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR4P51679 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR4P51679 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR4P51679 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR4P51679 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR4P51679 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR4P51679 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR4P51679 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR4P51679 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR4P51679 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR4P51679 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR4P51679 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR4P51679 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR4P51679 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR4P51679 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR4P51679 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR4P51679 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR4P51679 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR4P51679 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR4P51679 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR4P51679 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR4P51679 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR4P51679 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR4P51679 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR4P51679 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR4P51679 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR4P51679 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR4P51679 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR4P51679 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR4P51679 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR4P51679 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR4P51679 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR4P51679 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR4P51679 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR4P51679 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR4P51679 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR4P51679 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR4P51679 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR4P51679 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR4P51679 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR4P51679 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR4P51679 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR4P51679 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms