Protein–RNA interactions for Protein: P51003

PAPOLA, Poly(A) polymerase alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLAP51003 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAPOLAP51003 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAPOLAP51003 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PAPOLAP51003 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PAPOLAP51003 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAPOLAP51003 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAPOLAP51003 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAPOLAP51003 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAPOLAP51003 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAPOLAP51003 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAPOLAP51003 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAPOLAP51003 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAPOLAP51003 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAPOLAP51003 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PAPOLAP51003 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PAPOLAP51003 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PAPOLAP51003 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PAPOLAP51003 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PAPOLAP51003 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PAPOLAP51003 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PAPOLAP51003 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PAPOLAP51003 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAPOLAP51003 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAPOLAP51003 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAPOLAP51003 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAPOLAP51003 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAPOLAP51003 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PAPOLAP51003 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAPOLAP51003 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAPOLAP51003 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAPOLAP51003 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAPOLAP51003 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAPOLAP51003 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAPOLAP51003 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAPOLAP51003 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAPOLAP51003 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAPOLAP51003 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAPOLAP51003 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAPOLAP51003 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAPOLAP51003 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAPOLAP51003 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PAPOLAP51003 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAPOLAP51003 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PAPOLAP51003 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PAPOLAP51003 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAPOLAP51003 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAPOLAP51003 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAPOLAP51003 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAPOLAP51003 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAPOLAP51003 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAPOLAP51003 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAPOLAP51003 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAPOLAP51003 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAPOLAP51003 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAPOLAP51003 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAPOLAP51003 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAPOLAP51003 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAPOLAP51003 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAPOLAP51003 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAPOLAP51003 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAPOLAP51003 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAPOLAP51003 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAPOLAP51003 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PAPOLAP51003 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAPOLAP51003 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAPOLAP51003 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAPOLAP51003 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAPOLAP51003 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAPOLAP51003 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAPOLAP51003 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAPOLAP51003 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAPOLAP51003 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PAPOLAP51003 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PAPOLAP51003 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PAPOLAP51003 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PAPOLAP51003 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PAPOLAP51003 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PAPOLAP51003 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
PAPOLAP51003 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PAPOLAP51003 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAPOLAP51003 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAPOLAP51003 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAPOLAP51003 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAPOLAP51003 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAPOLAP51003 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PAPOLAP51003 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAPOLAP51003 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PAPOLAP51003 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PAPOLAP51003 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PAPOLAP51003 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PAPOLAP51003 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PAPOLAP51003 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PAPOLAP51003 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PAPOLAP51003 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PAPOLAP51003 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PAPOLAP51003 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PAPOLAP51003 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PAPOLAP51003 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PAPOLAP51003 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PAPOLAP51003 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms