Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLCSP50747 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLCSP50747 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLCSP50747 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLCSP50747 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HLCSP50747 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HLCSP50747 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HLCSP50747 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HLCSP50747 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HLCSP50747 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HLCSP50747 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HLCSP50747 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLCSP50747 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLCSP50747 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLCSP50747 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLCSP50747 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLCSP50747 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLCSP50747 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLCSP50747 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLCSP50747 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLCSP50747 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLCSP50747 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLCSP50747 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLCSP50747 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLCSP50747 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLCSP50747 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLCSP50747 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLCSP50747 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLCSP50747 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLCSP50747 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLCSP50747 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLCSP50747 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLCSP50747 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLCSP50747 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HLCSP50747 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HLCSP50747 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLCSP50747 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLCSP50747 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLCSP50747 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLCSP50747 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLCSP50747 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HLCSP50747 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLCSP50747 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLCSP50747 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLCSP50747 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLCSP50747 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLCSP50747 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLCSP50747 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLCSP50747 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLCSP50747 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLCSP50747 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HLCSP50747 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLCSP50747 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLCSP50747 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLCSP50747 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLCSP50747 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLCSP50747 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLCSP50747 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HLCSP50747 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLCSP50747 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLCSP50747 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLCSP50747 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLCSP50747 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLCSP50747 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLCSP50747 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLCSP50747 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HLCSP50747 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HLCSP50747 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLCSP50747 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLCSP50747 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLCSP50747 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLCSP50747 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLCSP50747 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLCSP50747 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLCSP50747 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLCSP50747 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLCSP50747 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLCSP50747 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLCSP50747 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLCSP50747 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLCSP50747 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLCSP50747 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLCSP50747 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLCSP50747 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLCSP50747 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLCSP50747 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLCSP50747 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLCSP50747 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLCSP50747 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLCSP50747 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLCSP50747 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLCSP50747 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLCSP50747 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLCSP50747 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HLCSP50747 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLCSP50747 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLCSP50747 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLCSP50747 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLCSP50747 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLCSP50747 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms