Protein–RNA interactions for Protein: P49721

PSMB2, Proteasome subunit beta type-2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB2P49721 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB2P49721 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB2P49721 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB2P49721 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB2P49721 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB2P49721 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB2P49721 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB2P49721 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB2P49721 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB2P49721 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB2P49721 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB2P49721 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB2P49721 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB2P49721 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB2P49721 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB2P49721 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB2P49721 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB2P49721 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB2P49721 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB2P49721 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB2P49721 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB2P49721 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB2P49721 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB2P49721 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB2P49721 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB2P49721 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB2P49721 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB2P49721 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB2P49721 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB2P49721 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB2P49721 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB2P49721 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB2P49721 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB2P49721 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB2P49721 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB2P49721 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB2P49721 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB2P49721 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB2P49721 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMB2P49721 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB2P49721 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB2P49721 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB2P49721 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB2P49721 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB2P49721 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB2P49721 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB2P49721 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB2P49721 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB2P49721 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB2P49721 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB2P49721 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB2P49721 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB2P49721 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB2P49721 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB2P49721 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB2P49721 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB2P49721 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB2P49721 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB2P49721 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB2P49721 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB2P49721 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB2P49721 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB2P49721 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB2P49721 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB2P49721 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB2P49721 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB2P49721 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB2P49721 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB2P49721 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB2P49721 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB2P49721 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB2P49721 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB2P49721 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB2P49721 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB2P49721 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB2P49721 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB2P49721 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB2P49721 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB2P49721 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB2P49721 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB2P49721 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB2P49721 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB2P49721 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB2P49721 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB2P49721 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB2P49721 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB2P49721 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB2P49721 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB2P49721 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMB2P49721 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMB2P49721 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMB2P49721 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMB2P49721 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMB2P49721 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMB2P49721 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB2P49721 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB2P49721 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB2P49721 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB2P49721 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB2P49721 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms