Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TGM4P49221 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TGM4P49221 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TGM4P49221 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TGM4P49221 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TGM4P49221 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TGM4P49221 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TGM4P49221 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TGM4P49221 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TGM4P49221 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TGM4P49221 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TGM4P49221 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TGM4P49221 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TGM4P49221 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TGM4P49221 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TGM4P49221 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TGM4P49221 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGM4P49221 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGM4P49221 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGM4P49221 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGM4P49221 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGM4P49221 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGM4P49221 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGM4P49221 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGM4P49221 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGM4P49221 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGM4P49221 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGM4P49221 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGM4P49221 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TGM4P49221 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TGM4P49221 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TGM4P49221 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TGM4P49221 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TGM4P49221 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TGM4P49221 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TGM4P49221 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TGM4P49221 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TGM4P49221 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TGM4P49221 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TGM4P49221 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TGM4P49221 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TGM4P49221 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TGM4P49221 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TGM4P49221 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TGM4P49221 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TGM4P49221 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TGM4P49221 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TGM4P49221 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGM4P49221 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGM4P49221 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGM4P49221 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TGM4P49221 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGM4P49221 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGM4P49221 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGM4P49221 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGM4P49221 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGM4P49221 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGM4P49221 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGM4P49221 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGM4P49221 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGM4P49221 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGM4P49221 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TGM4P49221 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TGM4P49221 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TGM4P49221 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TGM4P49221 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TGM4P49221 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TGM4P49221 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TGM4P49221 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TGM4P49221 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TGM4P49221 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TGM4P49221 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TGM4P49221 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TGM4P49221 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TGM4P49221 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TGM4P49221 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TGM4P49221 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TGM4P49221 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TGM4P49221 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TGM4P49221 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TGM4P49221 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TGM4P49221 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TGM4P49221 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TGM4P49221 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TGM4P49221 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TGM4P49221 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TGM4P49221 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TGM4P49221 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TGM4P49221 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TGM4P49221 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGM4P49221 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGM4P49221 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGM4P49221 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGM4P49221 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGM4P49221 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGM4P49221 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGM4P49221 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TGM4P49221 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TGM4P49221 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TGM4P49221 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms