Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GCLCP48506 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GCLCP48506 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GCLCP48506 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GCLCP48506 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GCLCP48506 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
GCLCP48506 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GCLCP48506 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GCLCP48506 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GCLCP48506 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GCLCP48506 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GCLCP48506 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GCLCP48506 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
GCLCP48506 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GCLCP48506 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GCLCP48506 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GCLCP48506 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GCLCP48506 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GCLCP48506 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
GCLCP48506 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GCLCP48506 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
GCLCP48506 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GCLCP48506 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GCLCP48506 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GCLCP48506 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GCLCP48506 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GCLCP48506 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GCLCP48506 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GCLCP48506 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GCLCP48506 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GCLCP48506 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GCLCP48506 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GCLCP48506 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GCLCP48506 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GCLCP48506 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GCLCP48506 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GCLCP48506 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GCLCP48506 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GCLCP48506 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GCLCP48506 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GCLCP48506 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GCLCP48506 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GCLCP48506 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GCLCP48506 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GCLCP48506 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GCLCP48506 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GCLCP48506 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GCLCP48506 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GCLCP48506 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GCLCP48506 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
GCLCP48506 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GCLCP48506 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GCLCP48506 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GCLCP48506 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GCLCP48506 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GCLCP48506 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GCLCP48506 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GCLCP48506 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GCLCP48506 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GCLCP48506 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GCLCP48506 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GCLCP48506 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GCLCP48506 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GCLCP48506 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GCLCP48506 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GCLCP48506 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GCLCP48506 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GCLCP48506 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GCLCP48506 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GCLCP48506 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GCLCP48506 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GCLCP48506 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GCLCP48506 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GCLCP48506 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GCLCP48506 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GCLCP48506 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GCLCP48506 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GCLCP48506 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
GCLCP48506 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GCLCP48506 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GCLCP48506 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GCLCP48506 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GCLCP48506 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GCLCP48506 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GCLCP48506 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GCLCP48506 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GCLCP48506 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GCLCP48506 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GCLCP48506 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GCLCP48506 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GCLCP48506 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GCLCP48506 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
GCLCP48506 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GCLCP48506 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GCLCP48506 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
GCLCP48506 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GCLCP48506 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GCLCP48506 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GCLCP48506 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GCLCP48506 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms