Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TM4SF4P48230 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TM4SF4P48230 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TM4SF4P48230 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TM4SF4P48230 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TM4SF4P48230 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TM4SF4P48230 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TM4SF4P48230 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TM4SF4P48230 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TM4SF4P48230 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TM4SF4P48230 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TM4SF4P48230 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TM4SF4P48230 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TM4SF4P48230 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TM4SF4P48230 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TM4SF4P48230 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TM4SF4P48230 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TM4SF4P48230 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TM4SF4P48230 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TM4SF4P48230 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TM4SF4P48230 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TM4SF4P48230 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TM4SF4P48230 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TM4SF4P48230 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TM4SF4P48230 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TM4SF4P48230 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TM4SF4P48230 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TM4SF4P48230 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TM4SF4P48230 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TM4SF4P48230 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TM4SF4P48230 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TM4SF4P48230 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TM4SF4P48230 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TM4SF4P48230 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TM4SF4P48230 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TM4SF4P48230 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TM4SF4P48230 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TM4SF4P48230 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TM4SF4P48230 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TM4SF4P48230 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TM4SF4P48230 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TM4SF4P48230 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TM4SF4P48230 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TM4SF4P48230 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TM4SF4P48230 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TM4SF4P48230 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TM4SF4P48230 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TM4SF4P48230 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TM4SF4P48230 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TM4SF4P48230 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TM4SF4P48230 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TM4SF4P48230 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TM4SF4P48230 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TM4SF4P48230 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TM4SF4P48230 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TM4SF4P48230 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TM4SF4P48230 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TM4SF4P48230 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TM4SF4P48230 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TM4SF4P48230 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TM4SF4P48230 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TM4SF4P48230 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TM4SF4P48230 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TM4SF4P48230 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TM4SF4P48230 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TM4SF4P48230 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TM4SF4P48230 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TM4SF4P48230 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TM4SF4P48230 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TM4SF4P48230 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TM4SF4P48230 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TM4SF4P48230 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TM4SF4P48230 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TM4SF4P48230 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TM4SF4P48230 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TM4SF4P48230 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TM4SF4P48230 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TM4SF4P48230 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TM4SF4P48230 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TM4SF4P48230 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TM4SF4P48230 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TM4SF4P48230 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TM4SF4P48230 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TM4SF4P48230 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TM4SF4P48230 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TM4SF4P48230 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TM4SF4P48230 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TM4SF4P48230 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TM4SF4P48230 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TM4SF4P48230 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TM4SF4P48230 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TM4SF4P48230 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TM4SF4P48230 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TM4SF4P48230 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TM4SF4P48230 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TM4SF4P48230 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TM4SF4P48230 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TM4SF4P48230 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TM4SF4P48230 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TM4SF4P48230 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms