Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP3P42574 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP3P42574 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP3P42574 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP3P42574 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP3P42574 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP3P42574 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP3P42574 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP3P42574 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP3P42574 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP3P42574 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP3P42574 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP3P42574 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP3P42574 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP3P42574 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP3P42574 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP3P42574 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP3P42574 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP3P42574 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CASP3P42574 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP3P42574 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP3P42574 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP3P42574 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP3P42574 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP3P42574 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP3P42574 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP3P42574 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP3P42574 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP3P42574 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP3P42574 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP3P42574 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP3P42574 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP3P42574 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP3P42574 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP3P42574 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP3P42574 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP3P42574 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP3P42574 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP3P42574 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP3P42574 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP3P42574 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP3P42574 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP3P42574 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP3P42574 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP3P42574 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP3P42574 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP3P42574 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP3P42574 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP3P42574 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP3P42574 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP3P42574 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP3P42574 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP3P42574 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP3P42574 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP3P42574 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP3P42574 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP3P42574 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP3P42574 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP3P42574 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP3P42574 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP3P42574 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP3P42574 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP3P42574 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP3P42574 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP3P42574 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP3P42574 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CASP3P42574 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CASP3P42574 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP3P42574 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP3P42574 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP3P42574 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP3P42574 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP3P42574 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP3P42574 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP3P42574 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP3P42574 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP3P42574 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP3P42574 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP3P42574 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP3P42574 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP3P42574 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP3P42574 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP3P42574 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP3P42574 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP3P42574 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP3P42574 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP3P42574 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP3P42574 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP3P42574 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP3P42574 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP3P42574 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP3P42574 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP3P42574 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP3P42574 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP3P42574 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP3P42574 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP3P42574 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP3P42574 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP3P42574 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP3P42574 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms