Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PIK3CAP42336 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PIK3CAP42336 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PIK3CAP42336 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PIK3CAP42336 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PIK3CAP42336 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PIK3CAP42336 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PIK3CAP42336 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PIK3CAP42336 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PIK3CAP42336 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PIK3CAP42336 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PIK3CAP42336 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PIK3CAP42336 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PIK3CAP42336 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PIK3CAP42336 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PIK3CAP42336 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PIK3CAP42336 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PIK3CAP42336 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIK3CAP42336 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIK3CAP42336 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIK3CAP42336 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIK3CAP42336 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIK3CAP42336 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIK3CAP42336 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIK3CAP42336 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIK3CAP42336 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PIK3CAP42336 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIK3CAP42336 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PIK3CAP42336 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIK3CAP42336 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIK3CAP42336 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PIK3CAP42336 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PIK3CAP42336 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PIK3CAP42336 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PIK3CAP42336 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PIK3CAP42336 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PIK3CAP42336 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PIK3CAP42336 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PIK3CAP42336 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PIK3CAP42336 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PIK3CAP42336 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIK3CAP42336 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIK3CAP42336 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIK3CAP42336 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIK3CAP42336 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIK3CAP42336 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIK3CAP42336 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIK3CAP42336 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIK3CAP42336 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIK3CAP42336 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIK3CAP42336 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIK3CAP42336 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PIK3CAP42336 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PIK3CAP42336 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PIK3CAP42336 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIK3CAP42336 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PIK3CAP42336 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIK3CAP42336 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIK3CAP42336 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIK3CAP42336 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PIK3CAP42336 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIK3CAP42336 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIK3CAP42336 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIK3CAP42336 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3CAP42336 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3CAP42336 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3CAP42336 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3CAP42336 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3CAP42336 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3CAP42336 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3CAP42336 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PIK3CAP42336 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PIK3CAP42336 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PIK3CAP42336 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PIK3CAP42336 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PIK3CAP42336 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PIK3CAP42336 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PIK3CAP42336 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PIK3CAP42336 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PIK3CAP42336 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PIK3CAP42336 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3CAP42336 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3CAP42336 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3CAP42336 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3CAP42336 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3CAP42336 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3CAP42336 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3CAP42336 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3CAP42336 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3CAP42336 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3CAP42336 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3CAP42336 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3CAP42336 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3CAP42336 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3CAP42336 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3CAP42336 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PIK3CAP42336 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PIK3CAP42336 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PIK3CAP42336 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PIK3CAP42336 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms