Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PBX2P40425 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PBX2P40425 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PBX2P40425 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PBX2P40425 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PBX2P40425 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PBX2P40425 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PBX2P40425 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PBX2P40425 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PBX2P40425 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PBX2P40425 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PBX2P40425 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PBX2P40425 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PBX2P40425 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PBX2P40425 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PBX2P40425 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PBX2P40425 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PBX2P40425 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PBX2P40425 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PBX2P40425 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PBX2P40425 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PBX2P40425 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PBX2P40425 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PBX2P40425 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PBX2P40425 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PBX2P40425 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PBX2P40425 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PBX2P40425 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PBX2P40425 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PBX2P40425 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PBX2P40425 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PBX2P40425 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PBX2P40425 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PBX2P40425 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PBX2P40425 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PBX2P40425 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PBX2P40425 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PBX2P40425 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PBX2P40425 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PBX2P40425 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PBX2P40425 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PBX2P40425 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PBX2P40425 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PBX2P40425 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PBX2P40425 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PBX2P40425 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PBX2P40425 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PBX2P40425 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PBX2P40425 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PBX2P40425 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PBX2P40425 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PBX2P40425 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PBX2P40425 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PBX2P40425 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PBX2P40425 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PBX2P40425 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PBX2P40425 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PBX2P40425 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PBX2P40425 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PBX2P40425 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PBX2P40425 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PBX2P40425 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PBX2P40425 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PBX2P40425 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PBX2P40425 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PBX2P40425 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PBX2P40425 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PBX2P40425 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PBX2P40425 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PBX2P40425 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PBX2P40425 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PBX2P40425 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PBX2P40425 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PBX2P40425 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PBX2P40425 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PBX2P40425 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PBX2P40425 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PBX2P40425 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PBX2P40425 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PBX2P40425 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PBX2P40425 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PBX2P40425 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PBX2P40425 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PBX2P40425 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PBX2P40425 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PBX2P40425 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PBX2P40425 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PBX2P40425 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PBX2P40425 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PBX2P40425 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PBX2P40425 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PBX2P40425 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PBX2P40425 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PBX2P40425 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PBX2P40425 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PBX2P40425 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PBX2P40425 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PBX2P40425 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PBX2P40425 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PBX2P40425 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms