Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PBX1P40424 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PBX1P40424 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PBX1P40424 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PBX1P40424 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PBX1P40424 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
PBX1P40424 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PBX1P40424 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PBX1P40424 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PBX1P40424 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PBX1P40424 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PBX1P40424 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PBX1P40424 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PBX1P40424 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PBX1P40424 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PBX1P40424 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PBX1P40424 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PBX1P40424 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PBX1P40424 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PBX1P40424 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PBX1P40424 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PBX1P40424 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PBX1P40424 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PBX1P40424 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PBX1P40424 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PBX1P40424 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PBX1P40424 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PBX1P40424 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PBX1P40424 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PBX1P40424 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PBX1P40424 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PBX1P40424 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PBX1P40424 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PBX1P40424 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PBX1P40424 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PBX1P40424 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PBX1P40424 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PBX1P40424 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PBX1P40424 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PBX1P40424 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PBX1P40424 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PBX1P40424 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PBX1P40424 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PBX1P40424 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PBX1P40424 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PBX1P40424 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PBX1P40424 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PBX1P40424 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PBX1P40424 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PBX1P40424 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PBX1P40424 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PBX1P40424 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PBX1P40424 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PBX1P40424 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PBX1P40424 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PBX1P40424 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PBX1P40424 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PBX1P40424 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PBX1P40424 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PBX1P40424 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PBX1P40424 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PBX1P40424 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PBX1P40424 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PBX1P40424 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PBX1P40424 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PBX1P40424 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PBX1P40424 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PBX1P40424 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PBX1P40424 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PBX1P40424 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PBX1P40424 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PBX1P40424 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PBX1P40424 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PBX1P40424 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PBX1P40424 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PBX1P40424 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PBX1P40424 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PBX1P40424 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PBX1P40424 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PBX1P40424 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PBX1P40424 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PBX1P40424 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PBX1P40424 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PBX1P40424 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PBX1P40424 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PBX1P40424 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PBX1P40424 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PBX1P40424 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PBX1P40424 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PBX1P40424 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PBX1P40424 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PBX1P40424 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PBX1P40424 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PBX1P40424 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PBX1P40424 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PBX1P40424 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PBX1P40424 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PBX1P40424 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PBX1P40424 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PBX1P40424 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms