Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FDFT1P37268 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FDFT1P37268 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FDFT1P37268 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FDFT1P37268 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FDFT1P37268 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FDFT1P37268 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FDFT1P37268 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FDFT1P37268 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FDFT1P37268 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FDFT1P37268 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FDFT1P37268 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FDFT1P37268 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FDFT1P37268 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FDFT1P37268 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FDFT1P37268 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FDFT1P37268 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FDFT1P37268 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FDFT1P37268 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FDFT1P37268 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FDFT1P37268 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FDFT1P37268 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FDFT1P37268 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FDFT1P37268 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FDFT1P37268 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FDFT1P37268 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FDFT1P37268 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FDFT1P37268 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FDFT1P37268 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FDFT1P37268 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FDFT1P37268 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FDFT1P37268 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FDFT1P37268 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FDFT1P37268 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FDFT1P37268 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FDFT1P37268 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FDFT1P37268 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FDFT1P37268 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FDFT1P37268 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FDFT1P37268 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FDFT1P37268 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FDFT1P37268 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FDFT1P37268 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FDFT1P37268 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FDFT1P37268 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FDFT1P37268 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FDFT1P37268 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FDFT1P37268 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FDFT1P37268 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FDFT1P37268 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FDFT1P37268 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FDFT1P37268 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FDFT1P37268 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FDFT1P37268 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FDFT1P37268 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FDFT1P37268 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FDFT1P37268 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FDFT1P37268 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FDFT1P37268 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FDFT1P37268 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FDFT1P37268 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FDFT1P37268 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FDFT1P37268 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FDFT1P37268 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FDFT1P37268 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FDFT1P37268 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FDFT1P37268 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FDFT1P37268 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FDFT1P37268 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FDFT1P37268 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FDFT1P37268 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FDFT1P37268 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FDFT1P37268 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FDFT1P37268 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FDFT1P37268 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FDFT1P37268 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FDFT1P37268 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FDFT1P37268 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FDFT1P37268 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FDFT1P37268 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FDFT1P37268 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FDFT1P37268 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FDFT1P37268 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FDFT1P37268 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FDFT1P37268 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FDFT1P37268 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FDFT1P37268 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FDFT1P37268 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FDFT1P37268 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FDFT1P37268 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FDFT1P37268 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FDFT1P37268 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FDFT1P37268 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FDFT1P37268 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FDFT1P37268 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FDFT1P37268 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FDFT1P37268 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FDFT1P37268 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FDFT1P37268 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FDFT1P37268 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 267.3 ms