Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LTBRP36941 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LTBRP36941 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBRP36941 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBRP36941 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBRP36941 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LTBRP36941 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LTBRP36941 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LTBRP36941 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LTBRP36941 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LTBRP36941 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LTBRP36941 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LTBRP36941 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LTBRP36941 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LTBRP36941 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LTBRP36941 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LTBRP36941 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LTBRP36941 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LTBRP36941 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LTBRP36941 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LTBRP36941 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LTBRP36941 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LTBRP36941 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LTBRP36941 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LTBRP36941 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LTBRP36941 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LTBRP36941 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LTBRP36941 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LTBRP36941 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LTBRP36941 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LTBRP36941 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LTBRP36941 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LTBRP36941 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LTBRP36941 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LTBRP36941 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LTBRP36941 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LTBRP36941 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LTBRP36941 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LTBRP36941 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LTBRP36941 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LTBRP36941 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LTBRP36941 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LTBRP36941 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LTBRP36941 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LTBRP36941 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LTBRP36941 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LTBRP36941 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LTBRP36941 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LTBRP36941 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LTBRP36941 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LTBRP36941 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LTBRP36941 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LTBRP36941 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LTBRP36941 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LTBRP36941 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LTBRP36941 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LTBRP36941 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LTBRP36941 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LTBRP36941 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LTBRP36941 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LTBRP36941 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LTBRP36941 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LTBRP36941 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LTBRP36941 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LTBRP36941 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LTBRP36941 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTBRP36941 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTBRP36941 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTBRP36941 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LTBRP36941 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTBRP36941 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTBRP36941 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTBRP36941 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTBRP36941 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTBRP36941 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTBRP36941 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LTBRP36941 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTBRP36941 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTBRP36941 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTBRP36941 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTBRP36941 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTBRP36941 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTBRP36941 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTBRP36941 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTBRP36941 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTBRP36941 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTBRP36941 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTBRP36941 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTBRP36941 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTBRP36941 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTBRP36941 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTBRP36941 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LTBRP36941 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTBRP36941 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LTBRP36941 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTBRP36941 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTBRP36941 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTBRP36941 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LTBRP36941 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LTBRP36941 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.2 ms