Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TGFBR1P36897 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TGFBR1P36897 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TGFBR1P36897 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TGFBR1P36897 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TGFBR1P36897 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TGFBR1P36897 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGFBR1P36897 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGFBR1P36897 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGFBR1P36897 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGFBR1P36897 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGFBR1P36897 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGFBR1P36897 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGFBR1P36897 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TGFBR1P36897 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TGFBR1P36897 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TGFBR1P36897 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TGFBR1P36897 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TGFBR1P36897 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TGFBR1P36897 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TGFBR1P36897 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TGFBR1P36897 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TGFBR1P36897 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TGFBR1P36897 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TGFBR1P36897 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TGFBR1P36897 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TGFBR1P36897 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TGFBR1P36897 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TGFBR1P36897 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TGFBR1P36897 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TGFBR1P36897 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TGFBR1P36897 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TGFBR1P36897 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TGFBR1P36897 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TGFBR1P36897 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TGFBR1P36897 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TGFBR1P36897 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TGFBR1P36897 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TGFBR1P36897 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TGFBR1P36897 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TGFBR1P36897 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TGFBR1P36897 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TGFBR1P36897 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGFBR1P36897 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGFBR1P36897 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGFBR1P36897 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TGFBR1P36897 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TGFBR1P36897 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TGFBR1P36897 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TGFBR1P36897 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TGFBR1P36897 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TGFBR1P36897 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TGFBR1P36897 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TGFBR1P36897 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TGFBR1P36897 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TGFBR1P36897 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TGFBR1P36897 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TGFBR1P36897 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TGFBR1P36897 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TGFBR1P36897 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGFBR1P36897 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TGFBR1P36897 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGFBR1P36897 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGFBR1P36897 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGFBR1P36897 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TGFBR1P36897 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TGFBR1P36897 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TGFBR1P36897 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TGFBR1P36897 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGFBR1P36897 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGFBR1P36897 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGFBR1P36897 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGFBR1P36897 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGFBR1P36897 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGFBR1P36897 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGFBR1P36897 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TGFBR1P36897 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGFBR1P36897 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGFBR1P36897 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGFBR1P36897 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGFBR1P36897 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TGFBR1P36897 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TGFBR1P36897 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TGFBR1P36897 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TGFBR1P36897 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TGFBR1P36897 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TGFBR1P36897 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TGFBR1P36897 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TGFBR1P36897 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TGFBR1P36897 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TGFBR1P36897 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TGFBR1P36897 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TGFBR1P36897 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TGFBR1P36897 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TGFBR1P36897 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TGFBR1P36897 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TGFBR1P36897 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TGFBR1P36897 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TGFBR1P36897 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TGFBR1P36897 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms