Protein–RNA interactions for Protein: P35914

HMGCL, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGCLP35914 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGCLP35914 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGCLP35914 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGCLP35914 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGCLP35914 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGCLP35914 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGCLP35914 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGCLP35914 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
HMGCLP35914 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMGCLP35914 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMGCLP35914 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMGCLP35914 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HMGCLP35914 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMGCLP35914 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMGCLP35914 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMGCLP35914 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMGCLP35914 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HMGCLP35914 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMGCLP35914 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMGCLP35914 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HMGCLP35914 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGCLP35914 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGCLP35914 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGCLP35914 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGCLP35914 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGCLP35914 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGCLP35914 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGCLP35914 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGCLP35914 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGCLP35914 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGCLP35914 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGCLP35914 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGCLP35914 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGCLP35914 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGCLP35914 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGCLP35914 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGCLP35914 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGCLP35914 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGCLP35914 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGCLP35914 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGCLP35914 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGCLP35914 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGCLP35914 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGCLP35914 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMGCLP35914 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMGCLP35914 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HMGCLP35914 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMGCLP35914 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMGCLP35914 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGCLP35914 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGCLP35914 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGCLP35914 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGCLP35914 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGCLP35914 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGCLP35914 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGCLP35914 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMGCLP35914 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMGCLP35914 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMGCLP35914 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMGCLP35914 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMGCLP35914 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMGCLP35914 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGCLP35914 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGCLP35914 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGCLP35914 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGCLP35914 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGCLP35914 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGCLP35914 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGCLP35914 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGCLP35914 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGCLP35914 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGCLP35914 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGCLP35914 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGCLP35914 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGCLP35914 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGCLP35914 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGCLP35914 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGCLP35914 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGCLP35914 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HMGCLP35914 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HMGCLP35914 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGCLP35914 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGCLP35914 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGCLP35914 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGCLP35914 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGCLP35914 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGCLP35914 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGCLP35914 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGCLP35914 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGCLP35914 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGCLP35914 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGCLP35914 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGCLP35914 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGCLP35914 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGCLP35914 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGCLP35914 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGCLP35914 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGCLP35914 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGCLP35914 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGCLP35914 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms