Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTNNA1P35221 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTNNA1P35221 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTNNA1P35221 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTNNA1P35221 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTNNA1P35221 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTNNA1P35221 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTNNA1P35221 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CTNNA1P35221 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTNNA1P35221 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTNNA1P35221 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTNNA1P35221 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTNNA1P35221 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTNNA1P35221 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTNNA1P35221 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTNNA1P35221 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTNNA1P35221 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTNNA1P35221 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTNNA1P35221 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTNNA1P35221 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTNNA1P35221 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CTNNA1P35221 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTNNA1P35221 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTNNA1P35221 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTNNA1P35221 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTNNA1P35221 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTNNA1P35221 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTNNA1P35221 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTNNA1P35221 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTNNA1P35221 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTNNA1P35221 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTNNA1P35221 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CTNNA1P35221 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTNNA1P35221 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTNNA1P35221 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTNNA1P35221 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTNNA1P35221 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTNNA1P35221 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTNNA1P35221 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTNNA1P35221 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTNNA1P35221 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTNNA1P35221 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTNNA1P35221 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTNNA1P35221 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTNNA1P35221 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTNNA1P35221 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTNNA1P35221 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTNNA1P35221 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTNNA1P35221 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTNNA1P35221 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTNNA1P35221 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTNNA1P35221 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTNNA1P35221 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTNNA1P35221 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTNNA1P35221 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTNNA1P35221 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTNNA1P35221 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTNNA1P35221 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTNNA1P35221 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTNNA1P35221 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTNNA1P35221 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTNNA1P35221 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTNNA1P35221 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTNNA1P35221 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTNNA1P35221 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTNNA1P35221 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTNNA1P35221 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTNNA1P35221 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTNNA1P35221 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTNNA1P35221 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTNNA1P35221 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTNNA1P35221 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTNNA1P35221 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTNNA1P35221 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTNNA1P35221 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTNNA1P35221 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTNNA1P35221 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTNNA1P35221 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CTNNA1P35221 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTNNA1P35221 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CTNNA1P35221 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTNNA1P35221 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTNNA1P35221 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTNNA1P35221 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTNNA1P35221 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTNNA1P35221 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CTNNA1P35221 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTNNA1P35221 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CTNNA1P35221 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTNNA1P35221 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTNNA1P35221 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTNNA1P35221 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTNNA1P35221 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTNNA1P35221 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTNNA1P35221 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTNNA1P35221 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTNNA1P35221 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTNNA1P35221 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTNNA1P35221 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTNNA1P35221 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms