Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GTF2H1P32780 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GTF2H1P32780 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF2H1P32780 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF2H1P32780 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF2H1P32780 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF2H1P32780 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF2H1P32780 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF2H1P32780 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF2H1P32780 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF2H1P32780 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF2H1P32780 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF2H1P32780 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2H1P32780 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2H1P32780 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2H1P32780 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2H1P32780 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2H1P32780 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2H1P32780 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2H1P32780 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2H1P32780 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2H1P32780 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2H1P32780 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2H1P32780 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2H1P32780 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2H1P32780 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2H1P32780 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2H1P32780 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2H1P32780 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF2H1P32780 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF2H1P32780 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF2H1P32780 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF2H1P32780 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF2H1P32780 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF2H1P32780 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF2H1P32780 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF2H1P32780 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF2H1P32780 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF2H1P32780 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GTF2H1P32780 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GTF2H1P32780 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GTF2H1P32780 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF2H1P32780 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF2H1P32780 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF2H1P32780 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF2H1P32780 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF2H1P32780 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF2H1P32780 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF2H1P32780 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF2H1P32780 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF2H1P32780 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF2H1P32780 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF2H1P32780 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF2H1P32780 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF2H1P32780 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF2H1P32780 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF2H1P32780 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF2H1P32780 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF2H1P32780 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF2H1P32780 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2H1P32780 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2H1P32780 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2H1P32780 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2H1P32780 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2H1P32780 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2H1P32780 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2H1P32780 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2H1P32780 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2H1P32780 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2H1P32780 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2H1P32780 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2H1P32780 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2H1P32780 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2H1P32780 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2H1P32780 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2H1P32780 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2H1P32780 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2H1P32780 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF2H1P32780 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF2H1P32780 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2H1P32780 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2H1P32780 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2H1P32780 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2H1P32780 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2H1P32780 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2H1P32780 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF2H1P32780 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF2H1P32780 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF2H1P32780 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF2H1P32780 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF2H1P32780 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF2H1P32780 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2H1P32780 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2H1P32780 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2H1P32780 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2H1P32780 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF2H1P32780 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF2H1P32780 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF2H1P32780 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2H1P32780 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms