Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD40LGP29965 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD40LGP29965 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD40LGP29965 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CD40LGP29965 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD40LGP29965 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CD40LGP29965 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CD40LGP29965 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CD40LGP29965 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CD40LGP29965 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CD40LGP29965 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CD40LGP29965 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD40LGP29965 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD40LGP29965 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD40LGP29965 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD40LGP29965 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD40LGP29965 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CD40LGP29965 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD40LGP29965 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CD40LGP29965 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CD40LGP29965 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CD40LGP29965 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD40LGP29965 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD40LGP29965 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD40LGP29965 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD40LGP29965 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD40LGP29965 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD40LGP29965 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD40LGP29965 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD40LGP29965 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CD40LGP29965 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD40LGP29965 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD40LGP29965 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CD40LGP29965 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD40LGP29965 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CD40LGP29965 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CD40LGP29965 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD40LGP29965 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD40LGP29965 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD40LGP29965 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD40LGP29965 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD40LGP29965 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD40LGP29965 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD40LGP29965 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD40LGP29965 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CD40LGP29965 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CD40LGP29965 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD40LGP29965 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD40LGP29965 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD40LGP29965 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CD40LGP29965 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CD40LGP29965 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CD40LGP29965 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD40LGP29965 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD40LGP29965 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CD40LGP29965 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD40LGP29965 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD40LGP29965 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD40LGP29965 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CD40LGP29965 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD40LGP29965 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD40LGP29965 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD40LGP29965 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD40LGP29965 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CD40LGP29965 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CD40LGP29965 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD40LGP29965 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD40LGP29965 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD40LGP29965 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD40LGP29965 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CD40LGP29965 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD40LGP29965 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD40LGP29965 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD40LGP29965 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD40LGP29965 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD40LGP29965 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD40LGP29965 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD40LGP29965 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD40LGP29965 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD40LGP29965 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD40LGP29965 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD40LGP29965 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD40LGP29965 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD40LGP29965 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD40LGP29965 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD40LGP29965 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD40LGP29965 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD40LGP29965 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD40LGP29965 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD40LGP29965 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD40LGP29965 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD40LGP29965 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD40LGP29965 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD40LGP29965 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD40LGP29965 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD40LGP29965 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD40LGP29965 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD40LGP29965 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD40LGP29965 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD40LGP29965 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms