Protein–RNA interactions for Protein: P28566

HTR1E, 5-hydroxytryptamine receptor 1E, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1EP28566 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTR1EP28566 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTR1EP28566 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTR1EP28566 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTR1EP28566 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTR1EP28566 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTR1EP28566 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTR1EP28566 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTR1EP28566 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTR1EP28566 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTR1EP28566 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HTR1EP28566 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTR1EP28566 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HTR1EP28566 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTR1EP28566 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTR1EP28566 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTR1EP28566 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTR1EP28566 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTR1EP28566 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTR1EP28566 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTR1EP28566 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTR1EP28566 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTR1EP28566 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTR1EP28566 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTR1EP28566 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTR1EP28566 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTR1EP28566 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTR1EP28566 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTR1EP28566 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTR1EP28566 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTR1EP28566 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTR1EP28566 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTR1EP28566 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTR1EP28566 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTR1EP28566 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTR1EP28566 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTR1EP28566 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTR1EP28566 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTR1EP28566 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTR1EP28566 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTR1EP28566 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTR1EP28566 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTR1EP28566 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTR1EP28566 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTR1EP28566 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTR1EP28566 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTR1EP28566 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HTR1EP28566 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HTR1EP28566 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HTR1EP28566 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HTR1EP28566 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HTR1EP28566 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HTR1EP28566 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HTR1EP28566 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTR1EP28566 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HTR1EP28566 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HTR1EP28566 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTR1EP28566 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTR1EP28566 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTR1EP28566 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTR1EP28566 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTR1EP28566 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HTR1EP28566 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTR1EP28566 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTR1EP28566 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTR1EP28566 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTR1EP28566 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTR1EP28566 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTR1EP28566 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTR1EP28566 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTR1EP28566 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTR1EP28566 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTR1EP28566 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTR1EP28566 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTR1EP28566 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTR1EP28566 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTR1EP28566 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTR1EP28566 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTR1EP28566 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTR1EP28566 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTR1EP28566 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HTR1EP28566 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTR1EP28566 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTR1EP28566 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTR1EP28566 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTR1EP28566 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTR1EP28566 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTR1EP28566 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTR1EP28566 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTR1EP28566 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HTR1EP28566 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTR1EP28566 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HTR1EP28566 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTR1EP28566 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTR1EP28566 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTR1EP28566 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTR1EP28566 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTR1EP28566 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTR1EP28566 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTR1EP28566 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.2 ms