Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFKBIAP25963 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFKBIAP25963 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFKBIAP25963 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFKBIAP25963 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFKBIAP25963 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFKBIAP25963 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFKBIAP25963 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NFKBIAP25963 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NFKBIAP25963 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFKBIAP25963 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NFKBIAP25963 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFKBIAP25963 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFKBIAP25963 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFKBIAP25963 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFKBIAP25963 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFKBIAP25963 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFKBIAP25963 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFKBIAP25963 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFKBIAP25963 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFKBIAP25963 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFKBIAP25963 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFKBIAP25963 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFKBIAP25963 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFKBIAP25963 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFKBIAP25963 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFKBIAP25963 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFKBIAP25963 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFKBIAP25963 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFKBIAP25963 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFKBIAP25963 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NFKBIAP25963 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFKBIAP25963 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFKBIAP25963 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFKBIAP25963 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFKBIAP25963 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFKBIAP25963 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NFKBIAP25963 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFKBIAP25963 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFKBIAP25963 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFKBIAP25963 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFKBIAP25963 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFKBIAP25963 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFKBIAP25963 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFKBIAP25963 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFKBIAP25963 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFKBIAP25963 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFKBIAP25963 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFKBIAP25963 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFKBIAP25963 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFKBIAP25963 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFKBIAP25963 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFKBIAP25963 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKBIAP25963 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKBIAP25963 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKBIAP25963 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKBIAP25963 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKBIAP25963 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKBIAP25963 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKBIAP25963 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFKBIAP25963 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFKBIAP25963 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFKBIAP25963 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFKBIAP25963 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFKBIAP25963 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFKBIAP25963 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFKBIAP25963 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFKBIAP25963 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFKBIAP25963 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFKBIAP25963 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFKBIAP25963 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFKBIAP25963 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFKBIAP25963 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFKBIAP25963 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFKBIAP25963 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFKBIAP25963 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFKBIAP25963 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NFKBIAP25963 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFKBIAP25963 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFKBIAP25963 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFKBIAP25963 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NFKBIAP25963 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFKBIAP25963 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFKBIAP25963 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFKBIAP25963 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFKBIAP25963 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFKBIAP25963 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFKBIAP25963 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFKBIAP25963 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFKBIAP25963 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFKBIAP25963 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFKBIAP25963 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFKBIAP25963 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFKBIAP25963 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFKBIAP25963 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFKBIAP25963 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFKBIAP25963 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NFKBIAP25963 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFKBIAP25963 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFKBIAP25963 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms