Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MCM3P25205 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCM3P25205 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCM3P25205 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCM3P25205 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCM3P25205 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCM3P25205 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCM3P25205 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCM3P25205 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCM3P25205 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCM3P25205 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCM3P25205 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCM3P25205 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCM3P25205 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCM3P25205 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCM3P25205 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCM3P25205 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCM3P25205 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCM3P25205 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCM3P25205 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCM3P25205 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCM3P25205 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCM3P25205 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCM3P25205 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCM3P25205 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCM3P25205 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCM3P25205 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCM3P25205 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCM3P25205 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCM3P25205 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCM3P25205 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCM3P25205 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCM3P25205 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCM3P25205 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCM3P25205 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCM3P25205 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCM3P25205 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCM3P25205 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCM3P25205 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCM3P25205 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCM3P25205 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCM3P25205 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCM3P25205 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCM3P25205 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCM3P25205 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MCM3P25205 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCM3P25205 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCM3P25205 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCM3P25205 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCM3P25205 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCM3P25205 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCM3P25205 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCM3P25205 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCM3P25205 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCM3P25205 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCM3P25205 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCM3P25205 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCM3P25205 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCM3P25205 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCM3P25205 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCM3P25205 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCM3P25205 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCM3P25205 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCM3P25205 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCM3P25205 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCM3P25205 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCM3P25205 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCM3P25205 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCM3P25205 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCM3P25205 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCM3P25205 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCM3P25205 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCM3P25205 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCM3P25205 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCM3P25205 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCM3P25205 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCM3P25205 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCM3P25205 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCM3P25205 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCM3P25205 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MCM3P25205 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCM3P25205 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCM3P25205 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCM3P25205 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM3P25205 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM3P25205 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM3P25205 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM3P25205 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM3P25205 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM3P25205 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM3P25205 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM3P25205 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM3P25205 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM3P25205 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM3P25205 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM3P25205 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM3P25205 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM3P25205 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM3P25205 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM3P25205 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms