Protein–RNA interactions for Protein: P24385

CCND1, G1/S-specific cyclin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND1P24385 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCND1P24385 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCND1P24385 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCND1P24385 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCND1P24385 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCND1P24385 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCND1P24385 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCND1P24385 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCND1P24385 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCND1P24385 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCND1P24385 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCND1P24385 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCND1P24385 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCND1P24385 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCND1P24385 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCND1P24385 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCND1P24385 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCND1P24385 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCND1P24385 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCND1P24385 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCND1P24385 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCND1P24385 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCND1P24385 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCND1P24385 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCND1P24385 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCND1P24385 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCND1P24385 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCND1P24385 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCND1P24385 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCND1P24385 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCND1P24385 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCND1P24385 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCND1P24385 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCND1P24385 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCND1P24385 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCND1P24385 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCND1P24385 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCND1P24385 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCND1P24385 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCND1P24385 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCND1P24385 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCND1P24385 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCND1P24385 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCND1P24385 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCND1P24385 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCND1P24385 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCND1P24385 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCND1P24385 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCND1P24385 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCND1P24385 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCND1P24385 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCND1P24385 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCND1P24385 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCND1P24385 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCND1P24385 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCND1P24385 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCND1P24385 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCND1P24385 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCND1P24385 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCND1P24385 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCND1P24385 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCND1P24385 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCND1P24385 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCND1P24385 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCND1P24385 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCND1P24385 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCND1P24385 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCND1P24385 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCND1P24385 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCND1P24385 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCND1P24385 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCND1P24385 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCND1P24385 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCND1P24385 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCND1P24385 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCND1P24385 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCND1P24385 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCND1P24385 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCND1P24385 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCND1P24385 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCND1P24385 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCND1P24385 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCND1P24385 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCND1P24385 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCND1P24385 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCND1P24385 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCND1P24385 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCND1P24385 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCND1P24385 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCND1P24385 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCND1P24385 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCND1P24385 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCND1P24385 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCND1P24385 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCND1P24385 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCND1P24385 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCND1P24385 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCND1P24385 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCND1P24385 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCND1P24385 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms