Protein–RNA interactions for Protein: P23378

GLDC, Glycine dehydrogenase (decarboxylating), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLDCP23378 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GLDCP23378 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GLDCP23378 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GLDCP23378 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GLDCP23378 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GLDCP23378 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GLDCP23378 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GLDCP23378 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GLDCP23378 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GLDCP23378 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GLDCP23378 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GLDCP23378 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GLDCP23378 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GLDCP23378 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GLDCP23378 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GLDCP23378 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GLDCP23378 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GLDCP23378 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GLDCP23378 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GLDCP23378 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GLDCP23378 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GLDCP23378 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GLDCP23378 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GLDCP23378 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GLDCP23378 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GLDCP23378 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GLDCP23378 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GLDCP23378 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GLDCP23378 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GLDCP23378 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GLDCP23378 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GLDCP23378 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GLDCP23378 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GLDCP23378 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GLDCP23378 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GLDCP23378 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GLDCP23378 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GLDCP23378 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GLDCP23378 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GLDCP23378 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GLDCP23378 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GLDCP23378 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GLDCP23378 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GLDCP23378 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GLDCP23378 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GLDCP23378 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GLDCP23378 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GLDCP23378 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GLDCP23378 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GLDCP23378 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GLDCP23378 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GLDCP23378 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GLDCP23378 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GLDCP23378 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GLDCP23378 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GLDCP23378 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GLDCP23378 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GLDCP23378 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GLDCP23378 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GLDCP23378 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GLDCP23378 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GLDCP23378 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GLDCP23378 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GLDCP23378 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GLDCP23378 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GLDCP23378 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GLDCP23378 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GLDCP23378 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GLDCP23378 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GLDCP23378 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GLDCP23378 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GLDCP23378 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GLDCP23378 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GLDCP23378 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GLDCP23378 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GLDCP23378 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GLDCP23378 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GLDCP23378 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GLDCP23378 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GLDCP23378 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GLDCP23378 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GLDCP23378 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLDCP23378 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLDCP23378 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLDCP23378 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLDCP23378 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLDCP23378 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLDCP23378 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLDCP23378 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLDCP23378 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLDCP23378 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GLDCP23378 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GLDCP23378 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GLDCP23378 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GLDCP23378 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GLDCP23378 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLDCP23378 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLDCP23378 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLDCP23378 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLDCP23378 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms