Protein–RNA interactions for Protein: P21695

GPD1, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase [NAD(+)], cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD1P21695 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPD1P21695 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPD1P21695 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPD1P21695 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPD1P21695 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPD1P21695 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPD1P21695 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPD1P21695 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPD1P21695 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPD1P21695 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPD1P21695 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPD1P21695 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPD1P21695 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPD1P21695 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPD1P21695 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPD1P21695 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPD1P21695 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPD1P21695 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPD1P21695 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPD1P21695 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPD1P21695 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPD1P21695 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPD1P21695 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPD1P21695 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPD1P21695 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPD1P21695 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPD1P21695 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPD1P21695 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPD1P21695 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPD1P21695 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPD1P21695 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPD1P21695 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GPD1P21695 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GPD1P21695 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPD1P21695 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPD1P21695 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPD1P21695 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPD1P21695 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPD1P21695 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPD1P21695 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPD1P21695 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPD1P21695 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPD1P21695 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPD1P21695 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GPD1P21695 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPD1P21695 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPD1P21695 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPD1P21695 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPD1P21695 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GPD1P21695 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPD1P21695 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPD1P21695 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPD1P21695 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPD1P21695 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPD1P21695 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPD1P21695 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPD1P21695 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPD1P21695 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPD1P21695 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPD1P21695 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPD1P21695 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPD1P21695 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPD1P21695 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPD1P21695 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GPD1P21695 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPD1P21695 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPD1P21695 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPD1P21695 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPD1P21695 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPD1P21695 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPD1P21695 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPD1P21695 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GPD1P21695 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPD1P21695 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPD1P21695 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPD1P21695 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPD1P21695 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPD1P21695 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPD1P21695 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPD1P21695 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPD1P21695 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPD1P21695 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPD1P21695 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPD1P21695 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPD1P21695 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPD1P21695 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPD1P21695 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPD1P21695 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPD1P21695 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPD1P21695 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPD1P21695 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPD1P21695 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPD1P21695 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPD1P21695 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPD1P21695 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GPD1P21695 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPD1P21695 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPD1P21695 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPD1P21695 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPD1P21695 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.4 ms