Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD247P20963 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD247P20963 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD247P20963 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD247P20963 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CD247P20963 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD247P20963 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD247P20963 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD247P20963 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD247P20963 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD247P20963 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD247P20963 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD247P20963 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD247P20963 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD247P20963 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD247P20963 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD247P20963 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD247P20963 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD247P20963 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD247P20963 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD247P20963 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD247P20963 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD247P20963 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD247P20963 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD247P20963 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD247P20963 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD247P20963 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD247P20963 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD247P20963 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD247P20963 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CD247P20963 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD247P20963 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD247P20963 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD247P20963 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD247P20963 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD247P20963 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD247P20963 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD247P20963 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CD247P20963 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CD247P20963 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD247P20963 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD247P20963 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD247P20963 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD247P20963 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD247P20963 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD247P20963 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD247P20963 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD247P20963 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD247P20963 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD247P20963 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD247P20963 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CD247P20963 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CD247P20963 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CD247P20963 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CD247P20963 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD247P20963 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD247P20963 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD247P20963 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD247P20963 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD247P20963 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD247P20963 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD247P20963 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD247P20963 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD247P20963 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD247P20963 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD247P20963 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD247P20963 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD247P20963 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD247P20963 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD247P20963 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD247P20963 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD247P20963 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD247P20963 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD247P20963 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD247P20963 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD247P20963 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD247P20963 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD247P20963 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD247P20963 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD247P20963 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD247P20963 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD247P20963 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD247P20963 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD247P20963 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD247P20963 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD247P20963 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD247P20963 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD247P20963 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD247P20963 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CD247P20963 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD247P20963 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD247P20963 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD247P20963 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD247P20963 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD247P20963 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD247P20963 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD247P20963 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD247P20963 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD247P20963 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD247P20963 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms