Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
HOXA5P20719 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms