Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMB1P20618 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMB1P20618 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMB1P20618 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMB1P20618 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMB1P20618 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMB1P20618 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMB1P20618 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMB1P20618 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMB1P20618 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMB1P20618 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMB1P20618 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMB1P20618 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMB1P20618 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMB1P20618 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMB1P20618 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMB1P20618 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMB1P20618 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMB1P20618 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMB1P20618 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMB1P20618 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMB1P20618 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMB1P20618 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMB1P20618 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMB1P20618 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMB1P20618 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMB1P20618 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMB1P20618 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMB1P20618 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMB1P20618 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMB1P20618 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMB1P20618 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMB1P20618 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB1P20618 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB1P20618 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB1P20618 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB1P20618 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB1P20618 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB1P20618 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB1P20618 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB1P20618 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB1P20618 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB1P20618 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB1P20618 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB1P20618 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB1P20618 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB1P20618 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB1P20618 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB1P20618 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB1P20618 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB1P20618 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB1P20618 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB1P20618 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB1P20618 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB1P20618 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB1P20618 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB1P20618 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB1P20618 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB1P20618 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB1P20618 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB1P20618 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB1P20618 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB1P20618 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB1P20618 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB1P20618 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB1P20618 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB1P20618 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMB1P20618 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMB1P20618 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMB1P20618 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMB1P20618 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMB1P20618 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMB1P20618 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMB1P20618 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMB1P20618 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMB1P20618 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMB1P20618 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMB1P20618 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMB1P20618 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMB1P20618 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMB1P20618 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMB1P20618 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMB1P20618 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMB1P20618 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMB1P20618 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMB1P20618 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMB1P20618 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB1P20618 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB1P20618 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB1P20618 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB1P20618 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB1P20618 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB1P20618 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB1P20618 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB1P20618 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB1P20618 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB1P20618 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB1P20618 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB1P20618 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB1P20618 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms