Protein–RNA interactions for Protein: P20061

TCN1, Transcobalamin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCN1P20061 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCN1P20061 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCN1P20061 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCN1P20061 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCN1P20061 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCN1P20061 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCN1P20061 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCN1P20061 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCN1P20061 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCN1P20061 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCN1P20061 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCN1P20061 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TCN1P20061 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCN1P20061 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCN1P20061 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCN1P20061 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCN1P20061 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TCN1P20061 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCN1P20061 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCN1P20061 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCN1P20061 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCN1P20061 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCN1P20061 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCN1P20061 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCN1P20061 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCN1P20061 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCN1P20061 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCN1P20061 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCN1P20061 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCN1P20061 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCN1P20061 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCN1P20061 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCN1P20061 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCN1P20061 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCN1P20061 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCN1P20061 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCN1P20061 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCN1P20061 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TCN1P20061 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCN1P20061 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCN1P20061 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCN1P20061 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCN1P20061 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCN1P20061 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCN1P20061 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TCN1P20061 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCN1P20061 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TCN1P20061 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCN1P20061 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCN1P20061 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCN1P20061 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TCN1P20061 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCN1P20061 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCN1P20061 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCN1P20061 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCN1P20061 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCN1P20061 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCN1P20061 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCN1P20061 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCN1P20061 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCN1P20061 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCN1P20061 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCN1P20061 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCN1P20061 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCN1P20061 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCN1P20061 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCN1P20061 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TCN1P20061 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCN1P20061 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCN1P20061 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCN1P20061 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCN1P20061 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCN1P20061 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCN1P20061 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCN1P20061 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCN1P20061 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCN1P20061 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCN1P20061 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCN1P20061 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCN1P20061 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCN1P20061 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TCN1P20061 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCN1P20061 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCN1P20061 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCN1P20061 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCN1P20061 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCN1P20061 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCN1P20061 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCN1P20061 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCN1P20061 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCN1P20061 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCN1P20061 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCN1P20061 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCN1P20061 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCN1P20061 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCN1P20061 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCN1P20061 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCN1P20061 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCN1P20061 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCN1P20061 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms