Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD53P19397 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD53P19397 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD53P19397 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD53P19397 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD53P19397 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD53P19397 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD53P19397 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD53P19397 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD53P19397 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD53P19397 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD53P19397 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD53P19397 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD53P19397 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD53P19397 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD53P19397 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CD53P19397 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD53P19397 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD53P19397 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD53P19397 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD53P19397 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD53P19397 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD53P19397 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD53P19397 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD53P19397 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD53P19397 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD53P19397 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CD53P19397 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD53P19397 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD53P19397 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CD53P19397 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD53P19397 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD53P19397 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD53P19397 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD53P19397 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CD53P19397 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD53P19397 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD53P19397 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CD53P19397 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CD53P19397 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CD53P19397 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CD53P19397 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CD53P19397 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD53P19397 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CD53P19397 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD53P19397 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD53P19397 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD53P19397 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD53P19397 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CD53P19397 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD53P19397 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD53P19397 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CD53P19397 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD53P19397 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD53P19397 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD53P19397 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CD53P19397 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD53P19397 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD53P19397 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD53P19397 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD53P19397 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD53P19397 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD53P19397 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD53P19397 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD53P19397 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD53P19397 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD53P19397 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD53P19397 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD53P19397 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD53P19397 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CD53P19397 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD53P19397 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD53P19397 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD53P19397 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD53P19397 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD53P19397 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD53P19397 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD53P19397 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD53P19397 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CD53P19397 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD53P19397 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD53P19397 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD53P19397 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD53P19397 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD53P19397 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD53P19397 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD53P19397 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD53P19397 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD53P19397 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD53P19397 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD53P19397 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD53P19397 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD53P19397 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD53P19397 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD53P19397 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD53P19397 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CD53P19397 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD53P19397 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD53P19397 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD53P19397 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms